Género de dinoflagelados
Amphidinium es un género de dinoflagelados . El tipo del género es Amphidinium operculatum Claparède & Lachmann. El género incluye la especie Amphidinium carterae que se utiliza como organismo modelo . [1]
Como dinoflagelados, Amphidinium spp. tienen cloroplastos . El genoma del cloroplasto de Amphidinium es inusual al no tener un solo genoma circular contiguo. [2] [3] En cambio, los genes del cloroplasto codificados en el ADN del cloroplasto se encuentran en numerosos minicírculos de 2-3 kbp , [2] [3] análogos a los plásmidos . La mayoría de los minicírculos tienen solo unos pocos genes codificadores de proteínas; muchos tienen solo un único gen . [2] [3] Hay informes de minicírculos que no tienen transcripciones conocidas, como en el genoma del cloroplasto de Amphidinium carterae , [3] aunque estos no se encontraron en el genoma del cloroplasto del clado C3 de Symbiodinium sp. [2] Las transcripciones derivadas de minicírculos se pueden procesar de formas no típicas de los eucariotas, incluida la adición de una cola de poli(U) 3', [3] a diferencia de la cola de poli(A) típica derivada de la poliadenilación de las transcripciones eucariotas. También se producen transcripciones antisentido derivadas de minicírculos, pero sin colas de poli(U) 3'. [3]
Véase también
- Luteofanol , un tipo de anfidinol presente en especies del género. [4]
Referencias
- ^ Nash, E.; Barbrook, A.; Edwards-Stuart, R.; Bernhardt, K.; Howe, C.; Nisbet, R. (2007). "Organización del genoma mitocondrial en el dinoflagelado Amphidinium carterae". Biología molecular y evolución . 24 (7): 1528–1536. doi : 10.1093/molbev/msm074 . PMID 17440175.
- ^ abcd Barbrook, Adrian C.; Voolstra, Christian R.; Howe, Christopher J. (2014). "El genoma del cloroplasto de un aislado del clado C3 de Symbiodinium sp." Protist . 165 (1): 1–13. doi : 10.1016/j.protis.2013.09.006 . hdl : 10754/563301 . PMID 24316380.
- ^ abcdef Dorrell, Richard G.; Nisbet, R. Ellen R.; Barbrook, Adrian C.; Rowden, Stephen JL; Howe, Christopher J. (2019). "Análisis genómico y transcriptómico integrado del plástido Amphidinium carterae, dinoflagelado de peridinina". Protist . 170 (4): 358–373. doi :10.1016/j.protis.2019.06.001. PMID 31415953. S2CID 198240765.
- ^ Y. Doi et al., "Luteofanol A, un nuevo compuesto polihidroxílico del dinoflagelado marino simbiótico Amphidinium sp.", Journal of Organic Chemistry (1997) doi :10.1021/jo970273l
Lectura adicional
- Pagliaraa, Patrizia; Caroppo, Carmela (noviembre de 2012). "Evaluación de la toxicidad de Amphidinium carterae, Coolia cfr. monotis y Ostreopsis cfr. ovata (Dinophyta) aisladas del norte del mar Jónico (mar Mediterráneo)". Toxicon . 60 (6): 1203–14. doi :10.1016/j.toxicon.2012.08.005. PMID 22925842.
- Murray, Shauna A.; Garby, Tamsyn; Hoppenrath, Mona; Neilan, Brett A. (4 de junio de 2012). "Diversidad genética, uniformidad morfológica y producción de policétidos en dinoflagelados (Amphidinium, Dinoflagellata)". PLOS ONE . 7 (6): e38253. Bibcode :2012PLoSO...738253M. doi : 10.1371/journal.pone.0038253 . PMC 3366924 . PMID 22675531.