Abre Babel

Open Babel es un software informático , un sistema experto en química utilizado principalmente para interconvertir formatos de archivos químicos . ^[3]

Acerca de

Debido a su fuerte relación con la informática, este programa pertenece más a la categoría de quimioinformática que a la de modelado molecular . Está disponible para Windows , Unix , Linux , macOS y Android . Es un software libre y de código abierto publicado bajo una Licencia Pública General GNU (GPL) 2.0.

El objetivo declarado del proyecto es: "Open Babel es un proyecto científico impulsado por la comunidad que ayuda tanto a los usuarios como a los desarrolladores como un programa y una biblioteca multiplataforma diseñados para respaldar el modelado molecular, la química y muchas áreas relacionadas, incluida la interconversión de formatos de archivos y datos".

Historia

Open Babel y JOELib se derivaron de la biblioteca de quimioinformática OELib . A su vez, OELib se basó en ideas del programa de química original Babel y una biblioteca de programación orientada a objetos aún no publicada llamada OBabel .

Características principales

• sistema experto químico
• Interconversión de muchos formatos de archivos químicos
• Búsqueda de subestructuras , basada en el sistema simplificado de entrada de líneas moleculares (SMILES)
• cálculo de huellas dactilares
• Generación de coordenadas 3D ^[4]
• Envoltorios para Python , Perl , Java , Ruby , C# ^[5]

Véase también

• Portal de software libre y de código abierto

• Avogadro : editor y constructor molecular basado en Open Babel
• Ghemical – programa de mecánica molecular basado en Open Babel
• JOELib – Versión Java de Open Babel y OELib
• XDrawChem – Programa de dibujo 2D basado en Open Babel
• Comparación de software para modelado de mecánica molecular
• Obelisco Azul ^[6]
• Lista de paquetes de software libre y de código abierto

Referencias

1. "Versión 3.1.1". 8 de mayo de 2020. Consultado el 9 de mayo de 2020 .
2. "Debian -- Detalles del paquete openbabel-gui en jessie" . Consultado el 10 de marzo de 2017 .
3. O'Boyle, NM; Banck, M.; James, CA; Morley, C.; Vandermeersch, T.; Hutchison, GR (2011). "Open Babel: una caja de herramientas química abierta". Journal of Cheminformatics . 3 : 33. doi : 10.1186/1758-2946-3-33 . PMC 3198950 . PMID  21982300. 
4. Yoshikawa, Naruki; Hutchison, Geoffrey R. (1 de agosto de 2019). "Generación rápida y eficiente de coordenadas basadas en fragmentos para Open Babel". Journal of Cheminformatics . 11 (1): 49. doi : 10.1186/s13321-019-0372-5 . PMC 6676618 . PMID  31372768. 
5. "Open Babel - la caja de herramientas de la química — Documentación de Open Babel openbabel-3-1-1". openbabel.org . Consultado el 18 de febrero de 2024 .
6. Guha, R.; Howard, MT; Hutchison, GR; Murray-Rust, P.; Rzepa , H .; Steinbeck, C .; Wegner, J.; Willighagen, EL (2006). "El obelisco azul: interoperabilidad en informática química". Revista de información y modelado químico . 46 (3): 991–998. doi :10.1021/ci050400b. PMC 4878861 . PMID  16711717. 

Enlaces externos

• Sitio web oficial
• E-BABEL – versión interactiva de Open Babel en el Laboratorio Virtual de Química Computacional
• Episodio 003 de chemCast: el desarrollador líder del proyecto, Geoff Hutchison, fue entrevistado en el podcast