El ARN OxyS es un ARN pequeño no codificante que se induce en respuesta al estrés oxidativo en Escherichia coli . Este ARN actúa como un regulador global para activar o reprimir la expresión de hasta 40 genes, mediante un mecanismo antisentido , incluido el activador transcripcional codificado por fhlA y la subunidad sigma(s) codificada por rpoS de la ARN polimerasa. [1] OxyS está unido por la proteína Hfq , que aumenta la interacción del ARN OxyS con sus mensajes objetivo. [2] [3] La unión a Hfq altera la conformación de OxyS. [4] Se cree que el ARN de 109 nucleótidos está compuesto por tres bucles de tallo .
Genes objetivo
Se predijeron y verificaron varios objetivos adicionales mediante análisis de microarrays. [5] Estos se enumeran a continuación:
- yobF – confirmado por análisis de Northern
- yaiZ
- ron A
- wrbA – confirmado por análisis de Northern
- ybaY – confirmado por análisis del Norte
Además, el ARNm codificado por el gen nusG es un objetivo directo de OxyS. [6]
Referencias
- ^ Altuvia, S; Zhang A; Argamán L; Tiwari A; Storz G (1998). "El ARN regulador OxyS de Escherichia coli reprime la traducción de fhlA bloqueando la unión a ribosomas". EMBO J. 17 (20): 6069–6075. doi :10.1093/emboj/17.20.6069. PMC 1170933 . PMID 9774350.
- ^ Zhang, A; Wassarman KM; Ortega J; Steven AC; Storz G (2002). "La proteína Hfq similar a Sm aumenta la interacción del ARN OxyS con los ARNm diana". Mol Cell . 9 (1): 11–22. doi : 10.1016/S1097-2765(01)00437-3 . PMID 11804582.
- ^ Holmqvist E, Wright PR, Li L, Bischler T, Barquist L, Reinhardt R, Backofen R, Vogel J (2016). "Patrones globales de reconocimiento de ARN de los reguladores postranscripcionales Hfq y CsrA revelados por reticulación UV in vivo". EMBO J . 35 (9): 991–1011. doi :10.15252/embj.201593360. PMC 5207318 . PMID 27044921.
- ^ Henderson, CA; Vincent, HA; Casamento, A; Stone, CM; Phillips, JO; Cary, PD; Sobott, F; Gowers, DM; Taylor, JE; Callaghan, AJ (agosto de 2013). "La unión de Hfq cambia la estructura de los ARN pequeños no codificantes OxyS y RprA de Escherichia coli, que están involucrados en la riborregulación de rpoS". ARN . 19 (8): 1089–1104. doi :10.1261/rna.034595.112. PMC 3708529 . PMID 23804244.
- ^ Tjaden B, Goodwin SS, Opdyke JA, et al. (2006). "Predicción de objetivos para ARN pequeños no codificantes en bacterias". Nucleic Acids Res . 34 (9): 2791–2802. doi :10.1093/nar/gkl356. PMC 1464411 . PMID 16717284.
- ^ Barshishat S, Elgraably-Weiss M, Edelstein J, Georg J, Govindarajan S, Haviv M, Wright PR, Hess WR, Altuvia S (2018). "El ARN pequeño OxyS induce la detención del ciclo celular para permitir la reparación del daño del ADN". EMBO J. 37 (3): 413–426. doi :10.15252/embj.201797651. PMC 5793797 . PMID 29237698.
Enlaces externos
- Página de OxyS RNA en Rfam
- Entrada de OxyS en la base de datos ncRNA
