APOBEC ("enzima de edición de ARNm de la apolipoproteína B, polipéptido catalítico") es una familia de citidina desaminasas conservadas evolutivamente .
Un mecanismo para generar diversidad de proteínas es la edición del ARNm . La familia de proteínas APOBEC realiza modificaciones del ARNm desaminando las bases de citidina a uracilo. El dominio N-terminal de las proteínas similares a APOBEC es el dominio catalítico, mientras que el dominio C-terminal es un dominio pseudocatalítico. Más específicamente, el dominio catalítico es un dominio de citidina desaminasa dependiente del zinc y es esencial para la desaminación de la citidina. El ion zinc con carga positiva en el dominio catalítico atrae la carga parcialmente negativa del ARN.
En el caso de APOBEC-1, se altera la transcripción del ARNm de la apolipoproteína B intestinal. La edición del ARN por APOBEC-1 requiere homodimerización y este complejo interactúa con las proteínas de unión al ARN para formar el editosoma . [2] La estructura resultante interactúa con el codón CAA en el codón 2153 y lo desamina en UAA, produciendo un codón de terminación que da como resultado un ARNm que se traduce en la isoforma apoB-48 intestinal . [3] Para otras transcripciones modificadas por APOBEC, como en la desaminación específica del sitio de un CGA a un codón de terminación UGA en el ARNm de la neurofibromatosis tipo 1 ( NF1 ), se predice que las proteínas resultantes también se trunquen, aunque estas transcripciones posiblemente se degraden. [4]
Las modificaciones de C a U no siempre dan como resultado el truncamiento de proteínas. Por ejemplo, en humanos y mamíferos ayudan a protegerse de infecciones virales. [5] [6] Las proteínas de la familia APOBEC se expresan ampliamente en células del sistema inmunitario innato humano. [7]
Estas enzimas, cuando se regulan de forma incorrecta, son una fuente importante de mutación en numerosos tipos de cáncer. [5] [6] [8] Cuando se desencadena la expresión de las proteínas de la familia APOBEC, las mutaciones accidentales en las células somáticas pueden conducir al desarrollo de oncogenes, células que tienen el potencial de convertirse en un tumor. Las proteínas APOBEC se expresan además en un intento de regular la formación de tumores. Esto hace que las proteínas APOBEC sean un marcador útil para diagnosticar tumores malignos. [9]
Una revisión de 2013 analizó los aspectos estructurales y biofísicos de las enzimas de la familia APOBEC3. [10] Muchas de las características de la proteína APOBEC se describen en la página de APOBEC3G , ampliamente estudiada. [ tono ]
Los genes humanos que codifican miembros de la familia de proteínas APOBEC incluyen:
Basado en ("Base estructural para la desaminación y mutagénesis dirigida de la citosina del ADN por APOBEC3A y APOBEC3B") en línea en Nature Structural and Molecular Biology.
