El análisis de similitudes (ANOSIM) es una prueba estadística no paramétrica ampliamente utilizada en el campo de la ecología . La prueba fue sugerida por primera vez por KR Clarke [1] como una prueba similar a ANOVA , donde en lugar de operar sobre datos brutos , opera sobre una matriz de disimilitud clasificada.
Dada una matriz de diferencias de rango entre un conjunto de muestras, cada una de las cuales pertenece a un solo sitio (por ejemplo, un solo grupo de tratamiento ), el ANOSIM prueba si podemos rechazar la hipótesis nula de que la similitud entre sitios es mayor o igual a la similitud dentro de cada sitio.
La estadística de prueba R se calcula de la siguiente manera:
donde r B es el promedio de similitudes de rango de pares de muestras (o réplicas) originadas en diferentes sitios, r W es el promedio de similitud de rango de pares entre réplicas dentro de los sitios, y M = n ( n − 1)/2 donde n es el número de muestras.
La estadística de prueba R está restringida entre los valores −1 a 1, donde los números positivos sugieren más similitud dentro de los sitios y los valores cercanos a cero representan que no hay diferencia entre los sitios y las similitudes dentro de los sitios. Los valores R negativos sugieren más similitud entre los sitios que dentro de los sitios y pueden aumentar la posibilidad de una asignación incorrecta de muestras a los sitios.
Para el propósito de la prueba de hipótesis , donde la hipótesis nula es que las similitudes dentro de los sitios son menores o iguales a las similitudes entre los sitios, la estadística R se compara generalmente con un conjunto de valores R′ que se logran por medio de la mezcla aleatoria de etiquetas de sitios entre las muestras y el cálculo del R′ resultante , repetido muchas veces. El porcentaje de veces que el R real superó los valores R′ derivados de las permutaciones es el valor p para la estadística R real .
La clasificación de disimilitud en ANOSIM y NMDS (escalamiento multidimensional no métrico) van de la mano. La combinación de ambos métodos complementa la visualización de las diferencias entre grupos junto con las pruebas de significación . [2]
ANOSIM se implementa en varios programas estadísticos, incluidos PRIMER, el paquete R Vegan [3] y PAST.