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ADN-C

El ADN-C , también conocido como ADN en forma de C , es una de las muchas posibles conformaciones de doble hélice del ADN . Se puede inducir al ADN a adoptar esta forma en condiciones particulares, como una humedad relativamente baja y la presencia de ciertos iones , como Li + o Mg2 + , pero el ADN en forma C no es muy estable y no se encuentra naturalmente en los organismos vivos. En 1961, Marvin [1] lo encontró cuando intentó repetir para la sal de Li el patrón de mayor contenido de agua de la sal de Na. Lo que Marvin encontró es el ADN-C semicristalino. "Semicristalino" describe un patrón de difracción en el que los reflejos cristalinos se ven a baja resolución pero se transforman continuamente a mayor resolución. [2]

Estructura

El C-DNA es una hélice no integral de dimensiones ligeramente variables, con valores medios de 3,32 Å para la unidad de elevación y 38,60° para la unidad de torsión, lo que da alrededor de 9 1/3 en lugar de 10 unidades por vuelta. [2] Hay algunos modelos diferentes para el ADN-C propuestos a lo largo de años. En 2000, van Dam y Levitt descubrieron que tanto el ADN-C como el ADN-B constan de dos conformaciones de nucleótidos distintas, BI y B-II. La proporción de conformación B-II en el ADN-C es superior al 40%, pero en el ADN-B la proporción es sólo de aproximadamente el 10%. La transición de la forma B a C en el ADN fibroso puede interpretarse en términos de cambios conformacionales BI y B-II. [3] La figura de ese artículo muestra el modal ideal de estas dos conformaciones publicadas por ellos. [4]

En experimentos se han utilizado contraiones como las amidas primarias en condiciones básicas para mostrar la relación entre las formas B y C del ADN. La forma y orientación general del ADN depende en gran medida de su secuencia primaria , así como de los enlaces de hidrógeno entre sus pares de bases, que estabilizan y mantienen la conformación de doble hélice. Se demostró que el C-DNA mantenía su conformación en ausencia de agua y podía formarse tras la deshidratación. [3] Se demostró que algunas amidas en condiciones básicas y baja humedad mantenían la conformación en forma C, pero pasaban suavemente al ADN en forma B a medida que aumentaba la humedad. Esto puede sugerir una fuerte correlación entre el ADN en forma C y en forma B, que también se observó usando sal de litio en condiciones de baja humedad. [5] [6]

Ver también

Referencias

  1. ^ Marvin, fiscal del distrito; Spencer, M.; Wilkins, MHF; Hamilton, LD (octubre de 1961). "La configuración molecular del ácido desoxirribonucleico III. Estudio de difracción de rayos X de la forma C de la sal de litio". Revista de biología molecular . 3 (5): 547–IN14. doi :10.1016/S0022-2836(61)80021-1. PMID  14470668.
  2. ^ ab Marvin, DA (1 de agosto de 2017). "Estudios de difracción de fibras de macromoléculas biológicas". Avances en Biofísica y Biología Molecular . 127 : 43–87. doi :10.1016/j.pbiomolbio.2017.04.005. ISSN  0079-6107. PMID  28442432.
  3. ^ ab Travers, AA; Muskhelishvili, G.; Thompson, JMT (28 de junio de 2012). "Información del ADN: del código digital a la estructura analógica". Transacciones filosóficas de la Royal Society A: Ciencias matemáticas, físicas y de ingeniería . 370 (1969): 2960–2986. doi : 10.1098/rsta.2011.0231 . ISSN  1364-503X. PMID  22615471. S2CID  890016.
  4. ^ van Dam, Lorens; Levitt, Malcolm H. (diciembre de 2000). "Nucleótidos BII en las formas B y C de ADN polimérico de secuencia natural: un nuevo modelo para la forma C de ADN". Revista de biología molecular . 304 (4): 541–561. doi :10.1006/jmbi.2000.4194. PMID  11099379.
  5. ^ Ghosh, Anirban; Bansal, Manju (1 de abril de 2003). "Un glosario de estructuras de ADN de la A a la Z". Acta Crystallographica Sección D: Cristalografía biológica . 59 (4): 620–626. doi :10.1107/S0907444903003251. ISSN  0907-4449. PMID  12657780.
  6. ^ Portugal, Franklin H. (1977). Un siglo de ADN: una historia del descubrimiento de la estructura y función de la sustancia genética. Jack S. Cohen. Cambridge, Massachusetts: MIT Press. ISBN 978-0-262-16067-4. OCLC  2964854.
  7. ^ Zimmerman, SB (junio de 1982). "La estructura tridimensional del ADN". Revista Anual de Bioquímica . 51 (1): 395–427. doi : 10.1146/annurev.bi.51.070182.002143. ISSN  0066-4154. PMID  7051961.
  8. ^ Sinden, Richard R. (1994). Estructura y función del ADN. San Diego: Prensa académica. ISBN 0-12-645750-6. OCLC  30109829.