ADARB1

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens.

La editasa 1 específica de ARN bicatenario es una enzima que en humanos está codificada por el gen ADARB1 . ^{[5] [6] [7]} La ​​enzima es miembro de la familia ADAR .

Función

"Este gen codifica la enzima responsable de la edición previa al ARNm de la subunidad B del receptor de glutamato mediante desaminación de adenosinas en un sitio específico" . Los estudios en ratas encontraron que esta enzima actuó sobre sus propias moléculas de pre-ARNm para convertir un dinucleótido AA en un dinucleótido AI, lo que resultó en un nuevo sitio de empalme . El corte y empalme alternativo de este gen da como resultado varias variantes de transcripción, algunas de las cuales se han caracterizado por la presencia o ausencia de un inserto de casete Alu y una región C-terminal corta o larga. ^[7]

ADARB1 requiere la pequeña molécula de inositol hexakisfosfato (IP ₆ ) para funcionar correctamente. ^[8] ADARB1 es una enzima de edición de ARN A-to-I que actúa principalmente sobre sustratos codificadores de proteínas . ^[9]

Ver también

• Adenosina desaminasa (ADA), una enzima que actúa sobre la adenosina aislada

Referencias

1. GRCh38: Ensembl lanzamiento 89: ENSG00000197381 - Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Ensembl lanzamiento 89: ENSMUSG00000020262 - Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia humana de PubMed:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia de PubMed del ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
5. Mittaz L, Scott HS, Rossier C, Seeburg PH, Higuchi M, Antonarakis SE (abril de 1997). "Clonación de una desaminasa de edición de ARN humano (ADARB1) de receptores de glutamato que se asigna al cromosoma 21q22.3". Genómica . 41 (2): 210–7. doi :10.1006/geno.1997.4655. PMID  9143496.
6. Keegan LP, Leroy A, Sproul D, O'Connell MA (febrero de 2004). "Adenosina desaminasas que actúan sobre el ARN (ADAR): enzimas editoras de ARN". Biología del genoma . 5 (2): 209. doi : 10.1186/gb-2004-5-2-209 . PMC 395743 . PMID  14759252. 
7. "Entrez Gene: adenosina desaminasa ADARB1, específica de ARN, B1 (rata homóloga de RED1)".
8. Macbeth MR, Schubert HL, Vandemark AP, Lingam AT, Hill CP, Bass BL (septiembre de 2005). "El hexakisfosfato de inositol está unido al núcleo de ADAR2 y es necesario para la edición del ARN". Ciencia . 309 (5740): 1534–9. Código bibliográfico : 2005 Ciencia... 309.1534M. doi : 10.1126/ciencia.1113150. PMC 1850959 . PMID  16141067. 
9. Licht K, Jantsch MF (abril de 2016). "Regulación rápida y dinámica del transcriptoma mediante edición y modificaciones de ARN". La revista de biología celular . 213 (1): 15-22. doi :10.1083/jcb.201511041. PMC 4828693 . PMID  27044895. 

Lectura adicional

• Valenzuela A, Blanco J, Callebaut C, Jacotot E, Lluis C, Hovanessian AG, Franco R (1997). "La envoltura del VIH-1 gp120 y las partículas virales bloquean la unión de la adenosina desaminasa a la CD26 humana". Peptidasas celulares en funciones y enfermedades inmunes . Avances en Medicina y Biología Experimentales. vol. 421, págs. 185–92. doi :10.1007/978-1-4757-9613-1_24. ISBN 978-1-4757-9615-5. PMID  9330696.
• Melcher T, Maas S, Herb A, Sprengel R, Seeburg PH, Higuchi M (febrero de 1996). "Una enzima de edición de ARN de mamíferos". Naturaleza . 379 (6564): 460–4. Código Bib :1996Natur.379..460M. doi :10.1038/379460a0. PMID  8559253. S2CID  4326456.
• O'Connell MA, Gerber A, Keller W (enero de 1997). "Purificación de la editasa 1 específica del ARN bicatenario humano (hRED1) implicada en la edición del pre-ARNm del receptor B de glutamato cerebral". La Revista de Química Biológica . 272 (1): 473–8. doi : 10.1074/jbc.272.1.473 . PMID  8995285.
• Valenzuela A, Blanco J, Callebaut C, Jacotot E, Lluis C, Hovanessian AG, Franco R (abril de 1997). "La unión de la adenosina desaminasa a la CD26 humana es inhibida por la glicoproteína gp120 de la envoltura del VIH-1 y partículas virales". Revista de Inmunología . 158 (8): 3721–9. doi : 10.4049/jimmunol.158.8.3721 . PMID  9103436.
• Lai F, Chen CX, Carter KC, Nishikura K (mayo de 1997). "Edición de los ARN del canal iónico de la subunidad B del receptor de glutamato mediante cuatro adenosina desaminasas de ARN bicatenario DRADA2 empalmadas alternativamente". Biología Molecular y Celular . 17 (5): 2413–24. doi :10.1128/MCB.17.5.2413. PMC  232090 . PMID  9111310.
• Yang JH, Sklar P, Axel R, Maniatis T (abril de 1997). "Purificación y caracterización de una ARN adenosina desaminasa humana para la edición del pre-ARNm del receptor B de glutamato". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 94 (9): 4354–9. Código bibliográfico : 1997PNAS...94.4354Y. doi : 10.1073/pnas.94.9.4354 . PMC  20726 . PMID  9113993.
• Gerber A, O'Connell MA, Keller W (mayo de 1997). "Dos formas de editasa 1 específica de ARN bicatenario humano (hRED1) generadas mediante la inserción de un casete de Alu". ARN . 3 (5): 453–63. PMC  1369496 . PMID  9149227.
• Villard L, Tassone F, Haymowicz M, Welborn R, Gardiner K (marzo de 1997). "Mapa de ubicación, organización genómica y patrones de expresión de la ARN editasa RED1 humana". Genética de células somáticas y moleculares . 23 (2): 135–45. doi :10.1007/BF02679972. PMID  9330641. S2CID  45104326.
• Blanco J, Valenzuela A, Herrera C, Lluís C, Hovanessian AG, Franco R (julio de 2000). "La gp120 del VIH-1 inhibe la unión de la adenosina desaminasa a CD26 mediante un mecanismo modulado por la expresión de CD4 y CXCR4". Cartas FEBS . 477 (1–2): 123–8. doi :10.1016/S0014-5793(00)01751-8. PMID  10899322. S2CID  22229481.
• Herrera C, Morimoto C, Blanco J, Mallol J, Arenzana F, Lluis C, Franco R (junio de 2001). "Comodulación de CXCR4 y CD26 en linfocitos humanos". La Revista de Química Biológica . 276 (22): 19532–9. doi : 10.1074/jbc.M004586200 . PMID  11278278.
• Maas S, Patt S, Schrey M, Rich A (diciembre de 2001). "Subedición del ARNm del receptor de glutamato GluR-B en gliomas malignos". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 98 (25): 14687–92. Código bibliográfico : 2001PNAS...9814687M. doi : 10.1073/pnas.251531398 . PMC  64742 . PMID  11717408.
• Jayan GC, Casey JL (abril de 2002). "Aumento de la edición de ARN e inhibición de la replicación del virus de la hepatitis delta mediante expresión de alto nivel de ADAR1 y ADAR2". Revista de Virología . 76 (8): 3819–27. doi :10.1128/JVI.76.8.3819-3827.2002. PMC  136091 . PMID  11907222.
• Jaikaran DC, Collins CH, MacMillan AM (octubre de 2002). "La edición de adenosina a inosina mediante ADAR2 requiere la formación de un complejo ternario en el sitio GluR-B R/G". La Revista de Química Biológica . 277 (40): 37624–9. doi : 10.1074/jbc.M204126200 . PMID  12163487.
• Jayan GC, Casey JL (diciembre de 2002). "Inhibición de la edición del ARN del virus de la hepatitis delta mediante una breve eliminación inhibidora mediada por ARN de ADAR1 pero no de la expresión de ADAR2". Revista de Virología . 76 (23): 12399–404. doi :10.1128/JVI.76.23.12399-12404.2002. PMC  136899 . PMID  12414985.
• Slavov D, Gardiner K (octubre de 2002). "Comparación filogenética de los genes y transcripciones ADAR2 de la adenosina desaminasa pre-ARNm: conservación y diversidad en la secuencia del sitio de edición y patrones de empalme alternativos". Gen.​ 299 (1–2): 83–94. doi :10.1016/S0378-1119(02)01016-8. PMID  12459255.

Enlaces externos

• Ubicación del genoma humano ADARB1 y página de detalles del gen ADARB1 en el Navegador del genoma de UCSC .