La competición masculina de 90 kg de judo en los Juegos Olímpicos de Verano de 2004 se celebró el 18 de agosto en el Salón Olímpico Ano Liossia .
Este evento fue el tercero más pesado de las categorías de peso de judo masculino, limitando a los competidores a un máximo de 90 kilogramos de masa corporal. Como todos los demás eventos de judo, los combates duraron cinco minutos. Si el combate seguía empatado al final, se extendía por otro período de cinco minutos, a muerte súbita; si ningún judoka puntuaba durante ese período, el combate era decidido por los jueces. El cuadro del torneo consistía en un combate de eliminación simple que culminaba en un combate por la medalla de oro. También había una repesca para determinar los ganadores de las dos medallas de bronce. Cada judoka que había perdido contra un semifinalista compitió en la repesca. Los dos judokas que perdieron en las semifinales se enfrentaron al ganador de la mitad opuesta del repesca del cuadro en combates por la medalla de bronce.
Todas las horas corresponden a la hora estándar de Grecia ( UTC+2 )
Los judokas eliminados en rondas anteriores por los cuatro semifinalistas del cuadro principal avanzaron a la repesca . Estos encuentros determinaron los dos medallistas de bronce del evento.