El equipo de fútbol americano San Diego State Aztecs de 2016 representó a la Universidad Estatal de San Diego en la temporada de fútbol americano FBS de la División I de la NCAA de 2016 . Los aztecas fueron dirigidos por el entrenador en jefe de sexto año Rocky Long y jugaron sus partidos en casa en el Qualcomm Stadium . Eran miembros de la División Oeste de la Conferencia Mountain West . Terminaron la temporada 11-3, 6-2 en el juego Mountain West para ser campeones de la División Oeste. Representaron a la División Oeste en el Juego de Campeonato de Mountain West , donde derrotaron a Wyoming para coronarse campeones de Mountain West por segundo año consecutivo. Fueron invitados al Las Vegas Bowl donde derrotaron a Houston .
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