El equipo de baloncesto masculino Charlotte 49ers 2012-13 representó a la Universidad de Carolina del Norte en Charlotte durante la temporada de baloncesto masculino de la División I de la NCAA 2012-13 . Los 49ers, dirigidos por el entrenador en jefe Alan Major , jugaron sus partidos en casa en el Dale F. Halton Arena y fueron miembros de la Conferencia Atlantic 10 . Este fue su último año en la Conferencia Atlantic 10 cuando se trasladaron a la Conferencia EE. UU. en 2014. Terminaron la temporada 21-12, 8-8 en el juego A-10 para terminar empatados a tres bandas en el octavo lugar. Perdieron en los cuartos de final del torneo Atlantic 10 ante Saint Louis. Fueron invitados al NIT 2013 donde perdieron en primera ronda ante Providence.
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