La temporada 2009-10 de la Liga Alef fue la primera temporada desde la temporada 1998-99 de la Liga Alef , en la que la Liga Alef recuperó su estatus como tercer nivel del fútbol israelí , debido al cierre de la Liga Artzit .
Maccabi Ironi Jatt (campeón de la División Norte) y Hapoel Herzliya (campeón de la División Sur) ganaron el título y el ascenso a la Liga Leumit .
Se celebraron los play-offs de ascenso y descenso, sin embargo, de los play-offs de ascenso, ningún club logró el ascenso a la Liga Leumit, ya que el ganador del play-off del segundo lugar de la Liga Alef, Maccabi HaShikma Ramat Hen, cayó ante Maccabi Be'er Sheva de la Liga Leumit en el partido decisivo.
Los clubes que ocuparon el segundo lugar en cada división, Ironi Sayid Umm al-Fahm y Maccabi HaShikma Ramat Hen, se enfrentaron en el Estadio Haberfeld, Rishon LeZion, y el ganador avanzó al partido decisivo del play-off contra el club que ocupó el 14º lugar en la Liga Leumit , Maccabi Be'er Sheva.
El Maccabi HaShikma Ramat Hen se clasificó para el partido decisivo del play-off contra el Maccabi Be'er Sheva.
El Maccabi Be'er Sheva permaneció en la Liga Leumit.
Hapoel Bnei Jadeidi (que reemplazó al club descalificado en el puesto 14 de la Liga Alef Norte, Hapoel Bnei Tamra) se enfrentó al ganador de los play-offs de la Liga Bet, Hapoel Ramot Menashe Megiddo. El ganador obtuvo un lugar en la Liga Alef 2010-11 .
Hapoel Bnei Jadeidi descendió a Liga Bet.
El club ubicado en el puesto 14 de la Liga Alef Sur, Shimshon Bnei Tayibe, se enfrentó al ganador de los play-offs de la Liga Bet, Ironi Ramla. El ganador obtuvo un lugar en la Liga Alef 2010-11 .
Shimshon Bnei Tayibe permaneció en la Liga Alef.