El equipo de baloncesto masculino Houston Cougars 2008-09 , también conocido como Houston Cougars , Houston o UH , representó a la Universidad de Houston en la temporada de baloncesto universitario 2008-09 . Fue su 64.º año de juego en la temporada. El entrenador en jefe de los Cougars fue Tom Penders , quien cumplía su quinto año en ese puesto. El equipo jugó sus partidos de local en el Hofheinz Pavilion en el campus de Houston, Texas . Los Cougars jugaron en el primer partido de la temporada de la División I de la NCAA en el 2K Sports College Classic .
Los Cougars de 2007-08 terminaron con un récord de 24-10 y fueron invitados a competir en el torneo inaugural College Basketball Invitational (CBI). Houston derrotó a Nevada y Valparaiso , pero fue derrotado en las semifinales por el rival de la Conference USA, Tulsa .