Grimsby Town Football Club entró en la temporada 2006-07 como miembro de la Liga Dos por tercera temporada consecutiva. El club fue dirigido por el nuevo nombramiento Graham Rodger . El club todavía tiene como objetivo abandonar Blundell Park en las próximas temporadas.
Los cuatro equipos relegados de la Liga Uno en 2005-06 ocuparían los cuatro primeros esta temporada, haciendo que Walsall, Hartlepool y Swindon volvieran a subir. Sin embargo, el Bristol Rovers ganó los play-offs y regresó a la League One después de seis años.
Torquay United había sido el último equipo en terminar último según el antiguo sistema electoral y el último equipo en terminar último en la Liga y sobrevivir debido a que los campeones de la Conferencia no tenían un terreno lo suficientemente bueno. Sin embargo, esta temporada terminaron últimos y abandonaron la Liga. A ellos se unió Boston United, que entró en administración en el minuto 87 del último partido de la temporada (pero aún así habría descendido incluso sin la penalización administrativa de 10 puntos).
Nota: Las banderas indican el equipo nacional tal como se define en las reglas de elegibilidad de la FIFA . Los jugadores pueden tener más de una nacionalidad no perteneciente a la FIFA.
La alineación inicial más frecuente utiliza la formación más utilizada del equipo: 4–4–2. Los jugadores utilizados son los que han jugado más partidos en cada posición respectiva, no necesariamente los que han jugado más partidos de todos los jugadores.
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