La Copa de la República Checa 2005-06 fue la 13.ª edición del torneo anual de eliminación directa de fútbol organizado por la Asociación Checa de Fútbol de la República Checa . Comenzó el 24 de julio de 2005 con la ronda preliminar y finalizó con la final el 19 de mayo de 2006.
El 19 de mayo de 2006, el AC Sparta de Praga se impuso en el Stadion u Nisy de Liberec al FC Baník Ostrava por penales (4-2,4464 espectadores). El AC Sparta de Praga se clasificó para la Copa de la UEFA 2006-07 .
La ronda preliminar tuvo lugar el 24 de julio de 2005.
Notas: 1: partido otorgado a Admira/Slavoj.
La primera ronda se jugó el 31 de julio de 2005.
La segunda ronda se jugó el 31 de agosto de 2005.
La tercera ronda se jugó el 21 de septiembre de 2005.
La cuarta ronda se jugó el 26 de octubre de 2005.
Los cuartos de final se jugaron entre el 12 y el 19 de abril de 2006.
Las semifinales se jugaron el 16 de mayo de 2006.