La temporada 2003-04 de la Gamma Ethniki fue la 21.ª desde el establecimiento oficial de la tercera división del fútbol griego en 1983. Kastoria fue coronado campeón, logrando así el ascenso a la Beta Ethniki . [1] AEL también logró el ascenso como subcampeón, e Ilisiakos también ascendió tras derrotar al PAS Giannina por 3-1 en un único partido de desempate en el Estadio Pyrgos entre el equipo que quedó en 14.º lugar de la Beta Ethniki y el equipo que quedó en 3.º lugar de la Gamma Ethniki. [2]
Chalkida , Leonidio , Pontiakos Nea Santa y Kilkisiakos fueron relegados a Delta Ethniki . [1]