La temporada 2003 de la Categoría Primera A fue la 55.ª temporada de la máxima categoría del fútbol colombiano . La temporada comenzó el 2 de febrero y concluyó el 21 de diciembre de 2003. Independiente Medellín fue el campeón defensor, tras haber ganado el torneo Finalización 2002 .
El Torneo Apertura (oficialmente Copa Mustang I 2003 por razones de patrocinio) fue el primer torneo de la temporada. El torneo comenzó el 2 de febrero y finalizó el 8 de junio.
La segunda fase del torneo consistió en dos grupos de cuatro equipos cada uno. En ella participaron los ocho mejores equipos de la primera fase del torneo. Los ganadores de cada grupo clasificaron a la final.
El Torneo Finalización (oficialmente Copa Mustang II 2003 por razones de patrocinio) fue el segundo torneo de la temporada. El torneo comenzó el 13 de julio y finalizó el 21 de diciembre.
Para determinar los cupos a la Copa Libertadores y a la Copa Sudamericana se utilizó una tabla agregada que incluía todos los partidos que jugó un equipo durante el año . El no campeón mejor ubicado se clasificó para la Copa Libertadores 2004 junto con los dos campeones de la temporada, mientras que el segundo y el tercer no campeón mejor ubicados se clasificaron para la Copa Sudamericana 2004 .
Reglas de clasificación: 1º promedio; 2º victorias; 3º diferencia de goles; 4º número de goles marcados; 5º goles marcados como visitante.