La temporada 1999-2000 de la 2. Bundesliga fue la vigésimo sexta temporada de la 2. Bundesliga , la segunda división del sistema de ligas de fútbol alemán .
El 1. FC Köln , el VfL Bochum y el FC Energie Cottbus ascendieron a la Bundesliga, mientras que el Tennis Borussia Berlin , el Fortuna Köln , el Kickers Offenbach y el Karlsruher SC descendieron a la Regionalliga . El Fortuna Köln había disputado hasta entonces todas las veintiséis temporadas de la 2. Bundesliga desde 1974 en la liga.
Para la temporada 1999-2000, SV Waldhof Mannheim , Kickers Offenbach , Chemnitzer FC y Alemannia Aachen ascendieron recientemente a la 2. Bundesliga de la Regionalliga, mientras que 1. FC Nürnberg , VfL Bochum y Borussia Mönchengladbach habían sido relegados a la liga desde la Bundesliga.
Los máximos goleadores de la liga: [1]