La temporada 1999-2000 de la Premier League israelí fue la primera de su historia. La liga se había creado para reemplazar a la antigua primera división, la Liga Leumit , que se convirtió en la segunda división del país.
Antes de que comenzara la temporada, el Ironi Ashdod y el Hapoel Ashdod de la Liga Alef se fusionaron para formar el FC Ashdod .
La temporada se desarrolló desde el primer partido el 14 de agosto de 1999 hasta el partido final el 27 de mayo de 2000. Hapoel Tel Aviv ganó el título, los equipos que descendieron fueron Hapoel Kfar Saba , Maccabi Herzliya y Hapoel Jerusalem .