La temporada 1998-99 de la División 1 fue la 24.ª y última temporada en la que la División 1 funcionó como segunda división del hockey sobre hielo en Suecia , por debajo de la máxima categoría, la Elitserien (actualmente la SHL). La Allsvenskan se fundó como la nueva liga de segundo nivel para la temporada 1999-2000. La División 1 se convirtió en la nueva liga de tercer nivel para la temporada siguiente.
La División 1 se dividió en cuatro grupos iniciales de ocho equipos cada uno. Los dos primeros equipos de cada grupo se clasificaron para la Allsvenskan, mientras que los seis equipos restantes tuvieron que competir en una ronda clasificatoria. Los equipos recibieron entre cero y cinco puntos de bonificación en función de su posición en la primera ronda. Los dos primeros equipos de cada ronda clasificatoria se clasificaron para los playoffs. Los cuatro peores equipos de cada grupo clasificatorio tuvieron que jugar una ronda de descenso en un intento de clasificarse para la nueva Allsvenskan para la temporada siguiente.
De los ocho equipos que compiten en la Allsvenskan, los dos primeros clasificados se clasificaron directamente para la Kvalserien . Los equipos que ocuparon el tercer puesto, el sexto y el tercero, se clasificaron para la segunda ronda de los playoffs. Los dos ganadores de los playoffs se clasificaron para la Kvalserien, en la que los dos primeros equipos se clasificaron para la siguiente temporada de la Elitserien.