La Copa de Bulgaria 1998-99 fue la 59.ª temporada de la Copa de Bulgaria . El CSKA de Sofía ganó la competición, venciendo al Litex Lovech por 1-0 en la final en el Stadion Balgarska Armia de Sofía . [1]
En esta ronda participan los ganadores de las rondas preliminares junto con los equipos del Grupo B.
En esta ronda participaron los ganadores de la Primera Ronda y todos los equipos del Grupo A.