La Copa de Fútbol de Bosnia y Herzegovina 1996-97 fue la tercera temporada de la copa anual de fútbol de Bosnia y Herzegovina . La Copa fue ganada por Sarajevo, que derrotó a Željezničar en la final.
Los partidos se jugaron el 30 de abril de 1997.
Los partidos de ida se jugaron el 14 de mayo y los de vuelta el 21 de mayo de 1997.