La temporada 1990-91 fue la 76.ª temporada de la Isthmian League , una competición de fútbol inglesa en la que participaron clubes semiprofesionales y amateurs de Londres, el este y el sureste de Inglaterra .
La liga estaba compuesta por tres divisiones. La Segunda División se dividió en dos secciones. Al final de la temporada, la Segunda División Norte y la Segunda División Sur se fusionaron en una sola División Dos, y se formó la Tercera División.
La Premier Division estaba formada por 22 clubes, incluidos 19 clubes de la temporada anterior y tres clubes nuevos:
La Primera División estaba formada por 22 clubes, incluidos 16 clubes de la temporada anterior y seis clubes nuevos:
Dos clubes descendidos de la Premier Division:
Dos clubes ascendidos de la División Dos Norte:
Dos clubes ascendidos de la División Dos Sur:
La División Dos Norte estaba compuesta por 22 clubes, incluidos 19 clubes de la temporada anterior y tres clubes nuevos:
Al final de la temporada, la División Dos Norte y la División Dos Sur se fusionaron en una sola División Dos y también se formó la División Tres. Finchley se fusionó con Wingate para formar Wingate & Finchley , que ocupó el lugar de Wingate en la División Premier de la Liga South Midlands , mientras que Basildon United se unió a la Liga Senior de Essex.
La División Dos Sur estaba compuesta por 22 clubes, incluidos 19 clubes de la temporada anterior y tres clubes nuevos:
Al final de la temporada, la División Dos Norte y la División Dos Sur se fusionaron en una sola División Dos y también se formó la División Tres.
Antes de que comenzara la siguiente temporada, Feltham se fusionó con el equipo de la Liga Helénica Hounslow FC para crear Feltham & Hounslow Borough FC.