El equipo de baloncesto masculino Kansas Jayhawks de 1988-89 representó a la Universidad de Kansas en la temporada 1988-89 de baloncesto masculino de la División I de la NCAA, que fue la temporada número 91 de baloncesto de los Jayhawks. El entrenador en jefe fue Roy Williams , quien cumplió su primer año en KU. El equipo jugó sus partidos de local en Allen Fieldhouse en Lawrence , Kansas . La temporada sigue siendo, a partir del torneo de 2024, el torneo más reciente para el que Kansas no se clasificó, debido a una prohibición de postemporada impuesta por la NCAA impuesta a KU por violaciones de reclutamiento cometidas por el ex entrenador Larry Brown . También sigue siendo, a partir de la temporada 2023-24, la última vez que Kansas no ganó 20 juegos.
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*No hubo encuesta de entrenadores en la semana 1.