La Copa FA de Irak 1988-89 fue la duodécima edición de la Copa FA de Irak como competición de clubes. El torneo lo ganó Al-Zawraa por quinta vez, venciendo a Al-Tayaran (ahora conocido como Al-Quwa Al-Jawiya) por 3-0 en la final. Las dos primeras rondas fueron entre equipos de las divisiones inferiores, antes de que los clubes de la máxima categoría ingresaran en los dieciseisavos de final .