El Torneo Merdeka de 1959 fue la tercera edición del Torneo Merdeka , un torneo anual que se celebraba en Malasia. Se celebró del 30 de agosto al 6 de septiembre y contó con la participación de siete países.
Se llevó a cabo una serie de eliminatorias para determinar qué equipos competirían en la segunda ronda. El partido entre Vietnam del Sur y Singapur tuvo que repetirse porque el marcador estaba empatado al final del primer partido.