La temporada de 1954 de los San Francisco 49ers fue la quinta temporada de la franquicia en la Liga Nacional de Fútbol Americano y la novena en total. El equipo venía de un récord de 9-3 en 1953, terminando un partido detrás de los Detroit Lions por un lugar en el juego del campeonato.
Los 49ers tuvieron un buen comienzo de temporada, comenzando la temporada con un récord de 4-0-1, ya que estaban tratando de terminar en la cima de la conferencia por primera vez en la historia del equipo. Los Niners perdieron sus siguientes 2 juegos contra los Chicago Bears y Los Angeles Rams por puntajes ajustados, pero aún así se encontraron en la carrera de los playoffs ya que ningún equipo se estaba escapando con la conferencia. Los Niners con 4-2-1 tuvieron un gran juego contra los Detroit Lions con 5-1-0 , que era un juego que San Francisco debía ganar. Pero los Lions tenían otras ideas, demoliendo a los 49ers 48-7, dejándolos con un récord de 4-3-1. San Francisco terminó la temporada con 3 victorias en sus últimos 4 juegos, terminando en tercer lugar con un récord de 7-4-1.
En la ofensiva, YA Tittle tuvo otra temporada sólida, lanzando para 2,205 yardas y 9 touchdowns, mientras completaba el 57.6% de sus pases. Billy Wilson lideró al club con 60 recepciones y 830 yardas y 5 touchdowns. El ataque terrestre de San Francisco fue abrumador. Joe Perry corrió para un récord de 1,049 yardas en la NFL, y John Johnson corrió para 681 yardas (el segundo total más alto en la NFL) y un récord del equipo de 9 touchdowns. Hugh McElhenny lideró al equipo con 8.0 yardas por acarreo hasta que se separó el hombro el 31 de octubre contra los Chicago Bears.
Joe Perry (FB), Bruno Banducci (G) y Leo Nomellini (DT) integraron el equipo All-Pro de Associated Press. Hugh McElhenny (HB), Billy Wilson (E) y Bob St. Clair (T) integraron el segundo equipo.