El 22 de septiembre de 1968 se celebraron elecciones generales en Guinea Española para elegir al Presidente y a la Asamblea Nacional que dirigirían el país cuando este obtuviera su independencia con el nombre de Guinea Ecuatorial más tarde ese mismo año. El 29 de septiembre se celebró una segunda vuelta de las elecciones presidenciales.
Francisco Macías Nguema, de la Idea Popular , lideró la primera vuelta y avanzó a una segunda vuelta con el primer ministro Bonifacio Ondó Edú . Con el respaldo de los candidatos eliminados Atanasio Ndongo y Edmundo Bossio , Macías Nguema derrotó a Ondó Edú en la segunda vuelta. El Movimiento de Unidad Nacional de Ondó Edú y el Movimiento de Liberación Nacional de Ndongo ganaron diez escaños cada uno en la Asamblea Nacional, mientras que la Idea Popular ganó ocho. [1] La participación electoral fue del 67 por ciento en la primera vuelta y del 79 por ciento en la segunda vuelta.
Tras la victoria de Macias Nguema, éste nombró a Ndongo como primer Ministro de Asuntos Exteriores de Guinea Ecuatorial y a Bossio como Vicepresidente, mientras que ordenó la ejecución de Ondó Edú poco después de la independencia. Hasta la fecha, han sido las únicas elecciones libres jamás celebradas en Guinea Ecuatorial. Durante los cuatro años siguientes, Macias Nguema consolidó su poder paso a paso; en 1970 creó el Partido Nacional Unido de los Trabajadores como el único partido legalmente permitido en el país y en 1972 se había declarado Presidente Vitalicio con poderes dictatoriales. Como resultado, las elecciones de 1968 serían las últimas elecciones disputadas celebradas en el país hasta 1993 .