El índice de clasificación de peroxirredoxinas ( PREX ) es una base de datos de peroxirredoxinas (Prxs) clasificadas en una de seis subfamilias distintas. [1] La clasificación se basa en el enfoque Deacon Active Site Profiling (DASP) que utiliza una matriz de puntuación específica de posición (PSSM) creada a partir de firmas alineadas (construidas a partir de fragmentos de secuencia que rodean los sitios activos de los miembros del grupo Prx caracterizados estructuralmente) para buscar bases de datos de secuencias. [2] Las búsquedas de PREX para Prx de interés se pueden realizar utilizando la anotación de proteínas, el número de acceso, la identificación de PDB, el nombre del organismo o la secuencia de proteínas (usando BLAST) para las proteínas Prx extraídas de las versiones de enero de 2008, noviembre de 2010 u octubre de 2011 de GenBank (más de 8000 secuencias de Prx validadas representadas). El resultado incluye la subfamilia a la que pertenece cada Prx clasificada, los números de acceso y GI, el género y la especie, y la firma del sitio activo utilizada para la clasificación. La secuencia de consulta también se presenta alineada con un grupo selecto de Prxs para su evaluación e interpretación manual por parte del usuario. Este recurso está disponible de forma gratuita para la comunidad de investigación.