El Índice Internacional de Proteínas ( IPI ) es una base de datos de proteínas extinta lanzada en 2001 por el Instituto Europeo de Bioinformática (EBI) y cerrada en 2011. Su propósito era proporcionar a la comunidad de proteómica un recurso que permita
En su última versión, el IPI contenía los conjuntos de referencia completos para seis especies animales: Homo sapiens (humano), Mus musculus (ratón), Rattus norvegicus (rata), Bos taurus (bovino), Gallus gallus (pollo) y Danio rerio ( pez cebra); y una especie vegetal: Arabidopsis thaliana (thale berro). Los conjuntos de datos de humanos, ratones y ratas fueron los primeros en desarrollarse, combinando información extraída de las bases de datos Swiss-Prot , TrEMBL , Ensembl y RefSeq . [1]
En 2001, cuando se lanzó el IPI, las bases de datos que catalogaban genes humanos variaban mucho y tenían pocos vínculos entre ellas. Desde entonces, se han producido muchos más datos dando una imagen más completa y las bases de datos han colaborado para sincronizar los datos. Actualmente, muchos organismos modelo tienen un conjunto de genes/proteínas de referencia que están catalogados en Ensembl / UniProt respectivamente, así como otras bases de datos específicas de especies. Debido a esta redundancia, el IPI se retiró en 2011. EBI recomendó a los usuarios de sus servicios que emplearan números de acceso de UniProtKB como identificadores de proteínas.