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Abrir árbol de la vida

Open Tree of Life es un árbol filogenético de la vida en línea , un esfuerzo colaborativo financiado por la National Science Foundation . [2] [3] El primer borrador, que incluye 2,3 millones de especies, se publicó en septiembre de 2015. [4] El gráfico interactivo permite al usuario ampliar las clasificaciones taxonómicas, los árboles filogenéticos y la información sobre un nodo. Al hacer clic en una especie, se devolverá su taxonomía de origen y de referencia.

El árbol de la vida en el nodo Eucariota.

Acercarse

El proyecto utiliza un enfoque de superárbol para generar un único árbol filogenético (disponible en tree.opentreeoflife.org [5] ) a partir de una taxonomía completa y un conjunto seleccionado de estimaciones filogenéticas publicadas.

La taxonomía es una combinación de varias clasificaciones grandes producidas por otros proyectos; se crea utilizando una herramienta de software llamada "smasher". [6] La taxonomía resultante se denomina taxonomía de árbol abierto (OTT) y se puede consultar en línea. [7]

Historia

El proyecto se inició en junio de 2012 con una subvención de tres años de la NSF para investigadores de diez universidades. En 2015, se otorgó una beca complementaria de dos años a investigadores de tres instituciones.

Ver también

Referencias

  1. ^ "Licencia OpenTreeOfLife".
  2. ^ Hinchliff CE, Smith SA, Allman JF, Burleigh JG, Chaudhary R, ​​Coghill LM, et al. (octubre de 2015). "Síntesis de filogenia y taxonomía en un árbol de la vida integral". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 112 (41): 12764–9. Código Bib : 2015PNAS..11212764H. doi : 10.1073/pnas.1423041112 . PMC 4611642 . PMID  26385966. 
  3. ^ "Ensamblaje, visualización y análisis del árbol de la vida". Fundación Nacional de Ciencias (NSF) . Consultado el 11 de febrero de 2016 .
  4. ^ Pennisi E (21 de septiembre de 2015). "El primer árbol completo de la vida muestra cuán relacionado estás con millones de especies". Revista de Ciencias .
  5. ^ "árbol abierto". Desarrolladores abiertos del Árbol de la vida.
  6. ^ Rees JA, Cranston K (2017). "Ensamblaje automatizado de una taxonomía de referencia para la síntesis de datos filogenéticos". Revista de datos de biodiversidad . 5 (5): e12581. doi : 10.3897/BDJ.5.e12581 . PMC 5515096 . PMID  28765728. 
  7. ^ "árbol.opentreeoflife.org".