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Proteína de unión al ADN de cadena sencilla

La proteína de unión al ADN monocatenario ( SSB ) es una proteína que se encuentra en la bacteria Escherichia coli ( E. coli ) y que se une a regiones monocatenarias del ácido desoxirribonucleico ( ADN ). [1] El ADN monocatenario se produce durante todos los aspectos del metabolismo del ADN: replicación, recombinación y reparación. Además de estabilizar este ADN monocatenario, las proteínas SSB se unen a numerosas proteínas implicadas en todos estos procesos y modulan su función.

La SSB activa de E. coli está compuesta por cuatro subunidades idénticas de 19 kDa . La unión del ADN monocatenario al tetrámero puede ocurrir en diferentes "modos", y la SSB ocupa diferentes cantidades de bases de ADN dependiendo de varios factores, incluida la concentración de sal. Por ejemplo, el modo de unión (SSB) 65 , en el que aproximadamente 65 nucleótidos de ADN se envuelven alrededor del tetrámero SSB y entran en contacto con sus cuatro subunidades, se favorece a altas concentraciones de sal in vitro . A concentraciones de sal más bajas, tiende a formarse el modo de unión (SSB) 35 , en el que aproximadamente 35 nucleótidos se unen a solo dos de las subunidades SSB. Se requieren más estudios para dilucidar las funciones de los diversos modos de unión in vivo .

SSB bacteriano

Los dominios de la proteína SSB en las bacterias son importantes en su función de mantener el metabolismo del ADN, más específicamente la replicación , reparación y recombinación del ADN. [2] Tiene una estructura de tres cadenas beta en una sola hoja beta de seis cadenas para formar un dímero de proteína . [3]

Véase también

Referencias

  1. ^ Shishmarev D, Wang Y, Mason CE, Su XC, Oakley AJ, Graham B, et al. (febrero de 2014). "Modo de unión intramolecular del extremo C de la proteína de unión al ADN monocatenario de Escherichia coli determinado por espectroscopia de resonancia magnética nuclear". Nucleic Acids Research . 42 (4): 2750–2757. doi :10.1093/nar/gkt1238. PMC  3936761 . PMID  24288378.
  2. ^ Meyer RR, Laine PS (diciembre de 1990). "La proteína de unión al ADN monocatenario de Escherichia coli". Microbiological Reviews . 54 (4): 342–380. doi :10.1128/MMBR.54.4.342-380.1990. PMC 372786 . PMID  2087220. 
  3. ^ Raghunathan S, Ricard CS, Lohman TM, Waksman G (junio de 1997). "Estructura cristalina del dominio de unión al ADN homotetramérico de la proteína de unión al ADN monocatenario de Escherichia coli determinada por difracción de rayos X de longitud de onda múltiple en la proteína selenometionil con una resolución de 2,9 A". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 94 (13): 6652–6657. doi : 10.1073/pnas.94.13.6652 . PMC 21213 . PMID  9192620. 
Este artículo incorpora texto de dominio público de Pfam e InterPro : IPR000635

Enlaces externos