TreeBASE [1] fue un repositorio de datos filogenéticos publicados en revistas científicas . En los estudios filogenéticos, se recopilan o generan datos de investigación, como observaciones comparativas (por ejemplo, matrices de estados de caracteres o alineaciones de secuencias múltiples ) realizadas sobre un conjunto de taxones , metadatos sobre estos taxones y los árboles filogenéticos que se infieren para describir mejor las relaciones evolutivas entre los taxones.
El propósito del proyecto TreeBASE fue proporcionar registros estables e identificadores para estos datos, de modo que otros trabajadores puedan hacer referencia a sus datos depositados en su publicación, y otros científicos puedan localizar los datos y usarlos para verificar la investigación original o incluirlos o ampliarlos en análisis posteriores.
El proyecto se inició en 1994, [2] [3] con financiación de la Fundación Nacional de Ciencias de EE. UU . Después de este prototipo, se inició un rediseño bajo el proyecto CIPRES [4] . Esta nueva versión se lanzó en marzo de 2010 y ha sido apoyada, entre otros, por el proyecto pPOD, [5] que financió la adición de una interfaz de servicio web RESTful con facilidades de búsqueda CQL , [6] y el Centro Nacional de Síntesis Evolutiva (NESCent), que alojó la base de datos y el servidor web.
A partir del invierno de 2010, TreeBASE se reorganizó y se asoció con la Fundación de Investigación en Filoinformática [7].
En 2022, TreeBASE se desconectó debido a problemas de seguridad que no se pudieron solucionar con los recursos del proyecto; el futuro de la base de datos es incierto. [8]