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Termo-toga

Thermotoga es un género del filo Thermotogota . Los miembros de Thermotoga son bacterias hipertermófilas cuya célula está envuelta en una membrana externa única, similar a una vaina, llamada "toga".

Los miembros del filo se tiñen como Gram-negativos ya que poseen un peptidoglicano delgado entre dos bicapas lipídicas, aunque ambas son peculiares. [2] El peptidoglicano es inusual ya que el enlace cruzado no es solo meso-diaminopimelato como ocurre en Pseudomonadota , sino D-lisina. [NB 1] [3]

Las especies son anaerobias con distintos grados de tolerancia al oxígeno y son capaces de reducir el azufre elemental (S0 ) a sulfuro de hidrógeno. [2]

No está claro si la termofilia es una innovación del linaje o un rasgo ancestral y no se puede determinar.
El genoma de Thermotoga maritima fue secuenciado en 1999, revelando varios genes de origen arqueológico, posiblemente permitiendo su adaptación termófila. [4] El contenido de CG (citosina-guanina) de T. maritima es del 46,2%; [2] la mayoría de los termófilos de hecho tienen un alto contenido de CG; esto ha llevado a la especulación de que el contenido de CG puede ser una consecuencia no esencial de la termofilia y no el impulsor de la termofilia. [5] [6]

Nombre

El artículo y el capítulo del manual de Bergey fueron escritos por varios autores, incluidos los microbiólogos Karl Stetter y Carl Woese . [2]

El nombre femenino neolatino "thermotoga" significa "la prenda exterior caliente", siendo una combinación del sustantivo griego θέρμη ( therme , calor) [7] o más correctamente el adjetivo θερμός, ή, όν ( thermos, e, on , caliente) [8] y el sustantivo femenino latino toga (la prenda exterior romana). [2]

Miembros y familiares

La relación precisa de Thermotogota con otros filos es objeto de debate ( v. filos bacterianos ): varios estudios han descubierto que se ramifica profundamente (en el manual de Bergey aparecía de hecho en "Volumen I: Las Archaea y las bacterias profundamente ramificadas y fototróficas"), [9] mientras que otros han descubierto que Firmicutes se ramifica profundamente y que Thermotogota se agrupa lejos de la base.

La especie tipo del género es T. maritima , descrita por primera vez en 1986. [2] En ese momento, fue la primera especie del filo en ser descrita. El género Thermotoga ahora contiene tres especies oficiales. [1] Recientemente, ocho especies fueron transferidas fuera del género y la mayoría de ellas terminaron dentro del género Pseudothermotoga por Bhandari & Gupta 2014. La cepa SL1 de T. subterranea se encontró en un depósito de petróleo continental profundo de 70 °C en la cuenca este de París, Francia . [10]

Filogenia

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con posición en la nomenclatura (LPSN) [1] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) [11].

Notas al pie

  1. ^ Todos los aminoácidos proteinogénicos tienen la configuración L-; en el peptidoglicano están presentes algunos aminoácidos con la configuración D-.
    La lisina es sintetizada a partir del meso-diaminopimelato por la diaminopimelato descarboxilasa.

Véase también

Referencias

  1. ^ abc JP Euzéby. "Thermotoga". Lista de nombres procariotas con posición en la nomenclatura (LPSN) . Consultado el 9 de septiembre de 2022 .
  2. ^ abcdef Huber, R.; TA Langworthy; H. Konig; M. Thomm; CR Woese; UB Sleytr; KO Stetter (1986). "Thermotoga maritima sp. nov. representa un nuevo género de eubacterias extremadamente termófilas únicas que crecen hasta 90 °C" (PDF) . Arch. Microbiol . 144 (4): 324–333. doi :10.1007/BF00409880. S2CID  12709437.
  3. ^ Boniface, A.; Parquet, C.; Arthur, M.; Mengin-Lecreulx, D.; Blanot, D. (2009). "La elucidación de la estructura del peptidoglicano de Thermotoga maritima revela dos nuevos tipos de enlaces cruzados". Journal of Biological Chemistry . 284 (33): 21856–21862. doi : 10.1074/jbc.M109.034363 . PMC 2755910 . PMID  19542229. 
  4. ^ Fraser, CM; Clayton, KE; Gill, RA; Gwinn, SR; Dodson, ML; Haft, RJ; Hickey, DH; Peterson, EK; Nelson, JD; Ketchum, WC; McDonald, KA; Utterback, L.; Malek, TR; Linher, JA; Garrett, KD; Stewart, MM; Cotton, AM; Pratt, MD; Phillips, MS; Richardson, CA; Heidelberg, D.; Sutton, J.; Fleischmann, GG; Eisen, RD; White, JA; Salzberg, O.; Smith, SL; Venter, HO; Fraser, JC (1999). "Evidencia de transferencia lateral de genes entre arqueas y bacterias a partir de la secuencia del genoma de Thermotoga maritima". Nature . 399 (6734): 323–329. Código Bibliográfico :1999Natur.399..323N. Documento descargado de http://www.revistaenciclopedialibre.com el 10/05/2016  .
  5. ^ Pasamontes, A.; Garcia-Vallve, S. (2006). "Uso de un método multidireccional para analizar la composición de aminoácidos de un grupo conservado de proteínas ortólogas en procariotas". BMC Bioinformatics . 7 : 257. doi : 10.1186/1471-2105-7-257 . PMC 1489954 . PMID  16709240. 
  6. ^ Puigbó, P.; Pasamontes, A.; García-Valléve, S. (2008). "Ganar y perder la adaptación termófila en procariotas". Tendencias en Genética . 24 (1): 10–14. doi :10.1016/j.tig.2007.10.005. PMID  18054113.
  7. ^ Fuente: Liddell, Henry George ; Scott, Robert ; Un léxico griego-inglés en el Proyecto Perseo
  8. ^ Fuente: Liddell, Henry George ; Scott, Robert ; Un léxico griego-inglés en el Proyecto Perseo
  9. ^ Boone, David R.; Castenholz, Richard W. (18 de mayo de 2001) [1984(Williams & Wilkins)]. George M. Garrity (ed.). Las arqueas y las bacterias fototróficas y de ramificación profunda . Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Vol. 1 (2.ª ed.). Nueva York: Springer. págs. 721. ISBN. 978-0-387-98771-2. Biblioteca Británica n.º GBA561951.
  10. ^ Li H, Yang SZ, Mu BZ, Rong ZF, Zhang J (2007). "Diversidad filogenética molecular de la comunidad microbiana asociada con un yacimiento de petróleo de alta temperatura en un campo petrolífero en alta mar". FEMS Microbiol Ecol . 60 (1): 74–84. doi : 10.1111/j.1574-6941.2006.00266.x . PMID  17286581.
  11. ^ Sayers; et al. "Thermotoga". Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Consultado el 9 de septiembre de 2022 .
  12. ^ "El LTP" . Consultado el 23 de febrero de 2022 .
  13. ^ "Árbol LTP_all en formato newick" . Consultado el 23 de febrero de 2022 .
  14. ^ "Notas de la versión LTP_01_2022" (PDF) . Consultado el 23 de febrero de 2022 .
  15. ^ "GTDB release 07-RS207". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 20 de junio de 2022 .
  16. ^ "bac120_r207.sp_labels". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 20 de junio de 2022 .
  17. ^ "Historia del taxón". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 20 de junio de 2022 .