NUDT21

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens

La subunidad 5 del factor de especificidad de escisión y poliadenilación ( CPSF5 ) es una enzima que en los humanos está codificada por el gen NUDT21 . ^{[5] [6]} Pertenece a la familia Nudix de hidrolasas.

La proteína codificada por este gen es una subunidad del complejo del factor de escisión Im, necesario para la escisión del ARN en el extremo 3' y el procesamiento de la poliadenilación. ^[7] La ​​interacción de la proteína con el ARN es uno de los primeros pasos en el ensamblaje del complejo de procesamiento del extremo 3' y facilita el reclutamiento de otros factores de procesamiento. Este gen codifica la subunidad de 25 kD del complejo proteico, que está compuesto por cuatro polipéptidos. ^[6]

Referencias

1. GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000167005 – Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000031754 – Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
5. Ruegsegger U, Blank D, Keller W (julio de 1998). "El factor de escisión de pre-ARNm humano Im está relacionado con las proteínas SR espliceosómicas y puede reconstituirse in vitro a partir de subunidades recombinantes". Mol Cell . 1 (2): 243–53. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80025-8 . PMID  9659921.
6. "Gen Entrez: motivo tipo nudix (fracción enlazada a nucleósido difosfato X) NUDT21 21".
7. Hardy, JG; Norbury, CJ (15 de agosto de 2016). "Factor de escisión Im (CFIm) como regulador de la poliadenilación alternativa". Biochemical Society Transactions . 44 (4): 1051–1057. doi :10.1042/BST20160078. PMID  27528751. S2CID  206156045.

Lectura adicional

• Rüegsegger U, Beyer K, Keller W (1996). "Purificación y caracterización del factor de escisión humano Im involucrado en el procesamiento del extremo 3' de los precursores del ARN mensajero". J. Biol. Chem . 271 (11): 6107–13. doi : 10.1074/jbc.271.11.6107 . PMID  8626397.
• de Vries H, Rüegsegger U, Hübner W, et al. (2000). "El factor de escisión IIm del pre-ARNm humano contiene homólogos de proteínas de levadura y une otros dos factores de escisión". EMBO J . 19 (21): 5895–904. doi :10.1093/emboj/19.21.5895. PMC  305781 . PMID  11060040.
• Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). "Clonación de ADN mediante recombinación específica de sitio in vitro". Genome Res . 10 (11): 1788–95. doi :10.1101/gr.143000. PMC  310948 . PMID  11076863.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). "Hacia un catálogo de genes y proteínas humanas: secuenciación y análisis de 500 nuevos ADNc humanos que codifican proteínas completas". Genome Res . 11 (3): 422–35. doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC  311072 . PMID  11230166.
• Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, et al. (2001). "Localización subcelular sistemática de nuevas proteínas identificadas mediante secuenciación de ADNc a gran escala". EMBO Rep . 1 (3): 287–92. doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC  1083732 . PMID  11256614.
• Kim H, Lee Y (2002). "Interacción de la poli(A) polimerasa con la subunidad de 25 kDa del factor de escisión I". Biochem. Biophys. Res. Commun . 289 (2): 513–8. doi :10.1006/bbrc.2001.5992. PMID  11716503.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias completas de ADNc humano y de ratón". Proc. Natl. Sci. EE. UU . . 99 (26): 16899–903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932.
• Awasthi S, Alwine JC (2003). "Asociación del factor de escisión de poliadenilación I con U1 snRNP". ARN . 9 (11): 1400–9. doi :10.1261/rna.5104603. PMC  1287061 . PMID  14561889.
• Brown KM, Gilmartin GM (2004). "Un mecanismo para la regulación del procesamiento del pre-ARNm 3' por el factor de escisión humano Im". Mol. Cell . 12 (6): 1467–76. doi : 10.1016/S1097-2765(03)00453-2 . ​​PMID  14690600.
• Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, et al. (2004). "Un mapa físico y funcional de la vía de transducción de señales TNF-alfa/NF-kappa B humana". Nat. Cell Biol . 6 (2): 97–105. doi :10.1038/ncb1086. PMID  14743216. S2CID  11683986.
• Dettwiler S, Aringhieri C, Cardinale S, et al. (2005). "Motivos de secuencia distintos dentro de la subunidad de 68 kDa del factor de escisión que median la unión del ARN, las interacciones proteína-proteína y la localización subcelular" (PDF) . J. Biol. Chem . 279 (34): 35788–97. doi : 10.1074/jbc.M403927200 . PMID  15169763. S2CID  39752996.
• Lehner B, Sanderson CM (2004). "Un marco de interacción de proteínas para la degradación del ARNm humano". Genome Res . 14 (7): 1315–23. doi :10.1101/gr.2122004. PMC  442147 . PMID  15231747.
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "El estado, la calidad y la expansión del proyecto de ADNc de longitud completa del NIH: la colección de genes de mamíferos (MGC)". Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928 . PMID  15489334.
• Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). "Del ORFeome a la biología: una línea de genómica funcional". Genome Res . 14 (10B): 2136–44. doi :10.1101/gr.2576704. PMC  528930 . PMID  15489336.
• Rush J, Moritz A, Lee KA, et al. (2005). "Perfiles de inmunoafinidad de la fosforilación de tirosina en células cancerosas". Nat. Biotechnol . 23 (1): 94–101. doi :10.1038/nbt1046. PMID  15592455. S2CID  7200157.
• Andersen JS, Lam YW, Leung AK, et al. (2005). "Dinámica del proteoma nucleolar". Nature . 433 (7021): 77–83. Bibcode :2005Natur.433...77A. doi :10.1038/nature03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
• Stelzl U, Worm U, Lalowski M, et al. (2005). "Una red de interacción proteína-proteína humana: un recurso para anotar el proteoma". Cell . 122 (6): 957–68. doi :10.1016/j.cell.2005.08.029. hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID  16169070. S2CID  8235923.
• Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). "Hacia un mapa a escala del proteoma de la red de interacción proteína-proteína humana". Nature . 437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, et al. (2006). "La base de datos LIFEdb en 2006". Nucleic Acids Res . 34 (número de la base de datos): D415–8. doi :10.1093/nar/gkj139. PMC  1347501 . PMID  16381901.