Género de bacterias
Mycolicibacterium es un género de bacterias grampositivas con forma de bastón de la familia Mycobacteriaceae del orden Mycobacteriales . [1]
En 2018, Gupta et al. demarcaron a los miembros de Mycolicibacterium del género más amplio Mycobacterium basándose en la evidencia de varios árboles filogenéticos construidos a partir de secuencias genómicas conservadas, análisis genómicos comparativos y valores promedio de identidad de aminoácidos. [1] Además de este género, el estudio propuso la división de Mycobacterium en un total de cinco géneros distintos, lo que encontró cierta resistencia por parte de algunos miembros de la comunidad científica. La resistencia se basó en el argumento de que Mycobacterium contiene algunas especies clínicamente relevantes y los cambios de nombre podrían causar confusión entre los médicos y otros investigadores. [2]
En 2020, Yamada et al. analizaron las propiedades morfológicas fundamentales de los nuevos géneros, incluido el diámetro celular, la longitud celular, el perímetro celular, la circularidad celular y la relación de aspecto, y determinaron que existían diferencias significativas entre los cinco géneros, lo que respalda la nueva división. [3]
El nombre Mycolicibacterium se deriva del latín acidum mycolicum (que se traduce como ácido micólico) y el sustantivo latino bacteria del sustantivo griego "bacteria" (que se traduce como varilla pequeña). En conjunto, el nombre se refiere a un género de ácido micólico que contiene bacterias con forma de varilla. [1]
Características bioquímicas y firmas moleculares[1]
Mycolicibacterium es un género de bacterias de rápido crecimiento que tarda menos de siete días en formar colonias. Sus miembros no son cromogénicos (no producen pigmentos) y dan positivo en la prueba de actividad de la arilsulfatasa de 3 días, la nitrato reductasa y la captación de hierro. La mayoría de las especies son saprofitas y pueden procesar materia orgánica en descomposición para obtener nutrientes. Aunque no se considera que los miembros de este género sean patógenos, se ha informado que algunas especies causan infecciones y enfermedades. El tamaño del genoma de Mycolicibacterium está entre 3,95 y 8,0 Mbp y su contenido de G+C está entre 65,4 y 70,3 mol % .
Se identificaron cuatro indeles de firma conservados (CSI) a través de análisis genómicos como presentes de forma única en este género en las siguientes proteínas: regulador transcripcional de la familia LacI, ciclasa , CDP-diacilglicerol-glicerol-3-fosfato 3-fosfatidiltransferasa y CDP-diacilglicerol-serina O-fosfatidiltransferasa . [1] Estos CSI sirven como un medio molecular confiable para distinguir a los miembros de esta Mycolicibacterium de otros géneros de la familia Mycobacteriaceae y todas las demás bacterias. Además, se identificaron 10 proteínas de firma conservadas (CSP) únicas para este género.
Especies
Mycolicibacterium comprende las siguientes especies: [4]
- " M. acapulense " Gupta et al. 2018
- M. agri (Tsukamura 1981) Gupta et al. 2018
- M. aichiense (Tsukamura 1981) Gupta et al. 2018
- M. alvei (Ausina et al. 1992) Gupta et al. 2018
- M. anyangense (Kim et al. 2015) Gupta et al. 2018
- M. arabiense (Zhang et al. 2013) Gupta et al. 2018
- M. arcueilense (Konjek et al. 2016) Gupta et al. 2018
- M. aromaticivorans (Hennessee et al. 2009) Gupta et al. 2018
- M. aubagnense (Adékambi et al. 2006) Gupta et al. 2018
- M. aurum (Tsukamura 1966) Gupta et al. 2018
- M. austroafricanum (Tsukamura et al. 1983) Gupta et al. 2018
- M. bacteremicum (Brown-Elliott y otros, 2012) Gupta y otros, 2018
- M. baixiangningiae Cheng et al. 2021
- M. boenickei (Schinsky et al. 2004) Gupta et al. 2018
- M. brisbanense (Schinsky y otros, 2004) Gupta y otros, 2018
- M. brumae (Luquin et al. 1993) Gupta et al. 2018
- M. canariasense (Jiménez et al. 2004) Gupta et al. 2018
- M. celeriflavum (Shahraki et al. 2015) Gupta et al. 2018
- M. chitae (Tsukamura 1967) Gupta et al. 2018
- M. chlorophenolicum (Apajalahti y otros, 1986) Gupta y otros, 2018
- M. chubuense (Tsukamura 1981) Gupta et al. 2018
- M. conceptionense (Adékambi et al. 2006) Gupta et al. 2018
- M. confluentis (Kirschner et al. 1992) Gupta et al. 2018
- M. cosmeticum (Cooksey y otros, 2004) Gupta y otros, 2018
- M. crocinum (Hennessee et al. 2009) Gupta et al. 2018
- M. diernhoferi (Tsukamura et al. 1983) Gupta et al. 2018
- M. doricum (Tortoli et al. 2001) Gupta et al. 2018
- M. duvalii (Stanford y Gunthorpe 1971) Gupta et al. 2018
- M. Elephantis (Shojaei et al. 2000) Gupta et al. 2018
- M. fallax (Lévy-Frébault et al. 1983) Gupta et al. 2018
- M. farcinogenes (Chamoiseau 1973) Gupta et al. 2018
- M. flavescens (Bojalil et al. 1962) Gupta et al. 2018
- M. fluoranthenivorans (Hormisch et al. 2006) Gupta et al. 2018
- M. fortuitum (da Costa Cruz 1938) Gupta et al. 2018
- M. frederiksbergense (Willumsen et al. 2001) Gupta et al. 2018
- M. gadium (Casal y Calero 1974) Gupta et al. 2018
- M. gilvum (Stanford y Gunthorpe 1971) Gupta et al. 2018
- " M. goodii " (Brown y otros, 1999) Gupta y otros, 2018
- " M. gossypii " Huang et al. 2021
- M. hassiacum (Schröder et al. 1997) Gupta et al. 2018
- M. helvum (Tran y Dahl 2016) Gupta et al. 2018
- M. hippocampi (Balcázar et al. 2014) Gupta et al. 2018
- M. hodleri (Kleespies et al. 1996) Gupta et al. 2018
- M. holsaticum (Richter et al. 2002) Gupta et al. 2018
- M. houstonense (Schinsky y col., 2004) Gupta y col., 2018
- M. insubricum (Tortoli et al. 2009) Gupta et al. 2018
- M. iranicum (Shojaei et al. 2013) Gupta et al. 2018
- " M. komanii " (Gcebe et al. 2018) Gupta et al. 2018
- M. komossense (Kazda y Müller 1979) Gupta et al. 2018
- M. litorale (Zhang et al. 2012) Gupta et al. 2018
- M. llatzerense (Gomila et al. 2008) Gupta et al. 2018
- M. lutetiense (Konjek et al. 2016) Gupta et al. 2018
- M. madagascariense (Kazda et al. 1992) Gupta et al. 2018
- M. mageritense (Domenech et al. 1997) Gupta et al. 2018
- M. malmesburyense (Gcebe y otros, 2017) Gupta y otros, 2018
- M. mengxianglii Cheng et al. 2021
- M. monacense (Reischl et al. 2006) Gupta et al. 2018
- " M. montmartrense " (Konjek et al. 2016) Gupta et al. 2018
- M. moriokaense (Tsukamura et al. 1986) Gupta et al. 2018
- M. mucogenicum (Springer et al. 1995) Gupta et al. 2018
- M. murale (Vuorio et al. 1999) Gupta et al. 2018
- M. neoaurum (Tsukamura 1972) Gupta et al. 2018
- M. neworleansense (Schinsky et al. 2004) Gupta et al. 2018
- M. nivoides Dahl y col. 2021
- M. novocastrense (Shojaei et al. 1997) Gupta et al. 2018
- M. obuense (Tsukamura y Mizuno 1981) Gupta et al. 2018
- M. oryzae (Ramaprasad et al. 2016) Gupta et al. 2018
- M. pallens (Hennessee et al. 2009) Gupta et al. 2018
- M. parafortuitum (Tsukamura 1966) Gupta et al. 2018
- M. peregrinum (Kusunoki y Ezaki 1992) Gupta et al. 2018
- M. phlei (Lehmann y Neumann 1899) Gupta et al. 2018
- M. phocaicum (Adékambi et al. 2006) Gupta et al. 2018
- M. porcinum (Tsukamura et al. 1983) Gupta et al. 2018
- M. poriferae (Padgitt y Moshier 1987) Gupta et al. 2018
- M. psychrotolerans (Trujillo et al. 2004) Gupta et al. 2018
- M. pulveris (Tsukamura et al. 1983) Gupta et al. 2018
- M. pyrenivorans (Derz et al. 2004) Gupta et al. 2018
- M. rhodesiae (Tsukamura 1981) Gupta et al. 2018
- M. rufum (Hennessee et al. 2009) Gupta et al. 2018
- M. rutilum (Hennessee et al. 2009) Gupta et al. 2018
- M. sarraceniae (Tran y Dahl 2016) Gupta et al. 2018
- M. sediminis (Zhang et al. 2013) Gupta et al. 2018
- M. senegalense (Chamoiseau 1973) Gupta et al. 2018
- M. septicum (Schinsky et al. 2000) Gupta et al. 2018
- M. setense (Lamy et al. 2008) Gupta et al. 2018
- M. smegmatis (Trevisan 1889) Gupta et al. 2018
- M. sphagni (Kazda 1980) Gupta et al. 2018
- M. stellerae Nouioui et al. 2019
- M. thermoresistibile (Tsukamura 1966) Gupta et al. 2018
- M. tokaiense (Tsukamura 1981) Gupta et al. 2018
- M. tusciae (Tortoli et al. 1999) Gupta et al. 2018
- M. vaccae (Bönicke y Juhasz 1964) Gupta et al. 2018
- " M. vinilichloridicum " Cortes-Albayay et al. 2021
- M. vulneris (van Ingen et al. 2009) Gupta et al. 2018
- M. wolinskyi (Brown et al. 1999) Gupta et al. 2018
Referencias
- ^ abcdefg Gupta, Radhey S.; Lo, Brian; Son, Jeen (13 de febrero de 2018). "La filogenómica y los estudios genómicos comparativos respaldan firmemente la división del género Mycobacterium en un género Mycobacterium modificado y cuatro géneros nuevos". Frontiers in Microbiology . 9 : 67. doi : 10.3389/fmicb.2018.00067 . ISSN 1664-302X. PMC 5819568 . PMID 29497402.
- ^ Tortoli, Enrico; Brown-Elliott, Barbara A.; Chalmers, James D.; Cirillo, Daniela M.; Daley, Charles L.; Emler, Stefan; Floto, R. Andrés; García, María J.; Hoefsloot, Wouter; Koh, Won-Jung; Lange, Christoph (1 de julio de 2019). "Misma carne, diferente salsa: ignore los nuevos nombres de las micobacterias". Revista respiratoria europea . 54 (1). doi : 10.1183/13993003.00795-2019 . ISSN 0903-1936. PMID 31296783. S2CID 195893005.
- ^ Yamada, Hiroyuki; Chikamatsu, Kinuyo; Aono, Akio; Murata, Kazuyoshi; Miyazaki, Naoyuki; Kayama, Yoko; Bhatt, Apoorva; Fujiwara, Nagatoshi; Maeda, Shinji; Mitarai, Satoshi (2020). "Las morfologías celulares fundamentales examinadas con Cryo-TEM de las especies de los cinco géneros novedosos se correlacionan sólidamente con la nueva clasificación en la familia Mycobacteriaceae". Fronteras en Microbiología . 11 : 562395. doi : 10.3389/fmicb.2020.562395 . ISSN 1664-302X. PMC 7701246 . PMID 33304323.
- ^ Euzéby JP, Parte AC. "Mycolicibacterium". Lista de nombres procariotas con posición en la nomenclatura (LPSN) . Consultado el 25 de junio de 2022 .
