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Mimivirus

Mimiviridae es una familia de virus . Las amebas y otros protistas sirven como huéspedes naturales. La familia se divide en hasta 4 subfamilias. [1] [2] [3] [4] Los virus de esta familia pertenecen al clado de virus de ADN grande nucleocitoplasmático (NCLDV), también conocidos como virus gigantes .

Mimiviridae es el único miembro reconocido del orden Imitervirales . Phycodnaviridae y Pandoraviridae de Algavirales son grupos hermanos de Mimiviridae en muchos análisis filogenéticos. [5]

Historia

El primer miembro de esta familia, Mimivirus, fue descubierto en 2003, [6] y la primera secuencia completa del genoma fue publicada en 2004. [7] Sin embargo, el virus mimivirus Cafeteria roenbergensis [8] fue aislado y parcialmente caracterizado en 1995, [9] aunque el huésped fue identificado erróneamente en ese momento y el virus fue designado BV-PW1. [8]

Taxonomía

Grupo: dsDNA

Orden: Imitervirales

La familia Mimiviridae se divide actualmente en tres subfamilias. [2] [3] [10]

La mayoría de los Mimiviridae parecen pertenecer a esta subfamilia (Mimivirus). [10]
A veces también se le denomina grupo I de Mimiviridae . [17]

Además, se ha propuesto ampliar Mimiviridae mediante un grupo III tentativo adicional (subfamilia Mesomimivirinae ) o clasificar este grupo como una familia hermana Mesomimiviridae en su lugar, [19] que comprende el OLPG heredado (Grupo Organic Lake Phycodna). Esta extensión (o familia hermana) puede consistir en lo siguiente:

Este grupo parece estar estrechamente relacionado con Mimiviridae más que con Phycodnaviridae y, por lo tanto, a veces se lo menciona como un candidato adicional a la subfamilia Mesomimivirinae . A veces, la familia extendida Mimiviridae se denomina Megaviridae, aunque esto no ha sido reconocido por ICTV; alternativamente, el grupo extendido puede denominarse simplemente Mimiviridae . [3] [23] [24] [25] [26] [17]

Con el reconocimiento del nuevo orden Imitervirales por parte del ICTV en marzo de 2020, ya no es necesario ampliar la familia Mimiviridae para que comprenda un grupo de virus con la alta diversidad observada. En cambio, la extensión (o al menos su clado principal ) puede denominarse familia hermana Mesomimiviridae . [19]

Aunque sólo se han descrito en detalle un par de miembros de este orden, parece probable que haya muchos más esperando ser descritos y asignados [27] [28] Los miembros no asignados incluyen el virus Aureococcus anophagefferens (AaV), CpV-BQ2 y Terra2. [ cita requerida ]

Estructura

Ultraestructura de las partículas del virus Bodo saltans y su replicación

[18] Los virus de la familia Mimiviridae tienen geometrías icosaédricas y redondeadas, con simetría entre T=972 y T=1141, o T=1200. El diámetro es de alrededor de 400 nm, con una longitud de 125 nm. Los genomas son lineales y no segmentados, con una longitud de alrededor de 1200 kb. El genoma tiene 911 marcos de lectura abiertos. [1]

Ciclo vital

La replicación sigue el modelo de desplazamiento de la cadena de ADN. El método de transcripción es la transcripción basada en ADN. La ameba actúa como huésped natural. [1]

Biología molecular

Se caracterizaron tres enzimas putativas de reparación por escisión de bases de ADN a partir de Mimivirus. [29] La vía de reparación por escisión de bases (BER) se reconstituyó experimentalmente utilizando las proteínas recombinantes purificadas uracilo-ADN glicosilasa (mvUDG), AP endonucleasa (mvAPE) y proteína ADN polimerasa X (mvPolX). [29] Cuando se reconstituyeron in vitro mvUDG, mvAPE y mvPolX funcionan de manera cohesiva para reparar el ADN que contiene uracilo predominantemente mediante reparación por escisión de bases de parche largo y, por lo tanto, estos procesos probablemente participan en la vía BER al principio del ciclo de vida de Mimivirus. [29]

Clínico

Los mimivirus se han asociado con la neumonía, pero actualmente se desconoce su importancia. [30] El único virus de esta familia aislado de un ser humano hasta la fecha es el LBA 111. [31] En el Instituto Pasteur de Irán (Teherán), los investigadores identificaron el ADN del mimivirus en muestras de lavado broncoalveolar (BAL) y esputo de un paciente infantil, utilizando PCR en tiempo real (2018). El análisis informó una homología del 99% de LBA111, linaje C del Megavirus chilensis . [32] Con solo unos pocos casos informados antes de este hallazgo, la legitimidad del mimivirus como una enfermedad infecciosa emergente en humanos sigue siendo controvertida. [33] [34]

El mimivirus también se ha relacionado con la artritis reumatoide . [35]

Véase también

Referencias

  1. ^ abc "Viral Zone". ExPASy . Consultado el 15 de junio de 2015 .
  2. ^ ab ICTV. "Taxonomía de virus: versión de 2014" . Consultado el 15 de junio de 2015 .
  3. ^ abcde Schulz, Frederik; Yutin, Natalya; Ivanova, Natalia N.; Ortega, Davi R.; Lee, Tae Kwon; Vierheilig, Julia; Daims, Holger; Horn, Matthias; Wagner, Michael (7 de abril de 2017). "Virus gigantes con un complemento ampliado de componentes del sistema de traducción" (PDF) . Science . 356 (6333): 82–85. Bibcode :2017Sci...356...82S. doi : 10.1126/science.aal4657 . ISSN  0036-8075. PMID  28386012. S2CID  206655792., Identificación UCPMS: 1889607, PDF
  4. ^ ab Abrahão, Jônatas; Silva, Lorena; Silva, Ludmila Santos; Khalil, Jacques Yaacoub Bou; Rodríguez, Rodrigo; Arantes, Thalita; Asís, Felipe; Borato, Paulo; Andrade, Miguel; Kroon, Erna Geessien; Ribeiro, Bergmann; Bergier, Iván; Seligmann, Hervé; Ghigo, Eric; Colson, Philippe; Levasseur, Antonio; Kroemer, Guido; Raoult, Didier; Scola, Bernard La (27 de febrero de 2018). "El Tupanvirus gigante de cola posee el aparato de traducción más completo de la virosfera conocida". Comunicaciones de la naturaleza . 9 (1): 749. Código bibliográfico : 2018NatCo...9..749A. doi :10.1038/s41467-018-03168-1. Número de modelo : PMID 29487281  .  Fig. 4 y §Discusión: "Considerando que los tupanvirus constituyen un grupo hermano de los mimivirus amebales..."
  5. ^ Bäckström D, Yutin N, Jørgensen SL, Dharamshi J, Homa F, Zaremba-Niedwiedzka K, Spang A, Wolf YI, Koonin EV, Ettema TJ (2019). "Los genomas de virus de sedimentos de aguas profundas expanden el megaviroma oceánico y respaldan orígenes independientes del gigantismo viral". mBio . 10 (2): e02497-18. doi :10.1128/mBio.02497-18. PMC 6401483 . PMID  30837339. PDF
  6. ^ Suzan-Monti, M; La Scola, B; Raoult, D (2006). "Aspectos genómicos y evolutivos de Mimivirus". Virus Res . 117 (1): 145–155. doi :10.1016/j.virusres.2005.07.011. PMID  16181700.
  7. ^ Raoult, D.; Audic, S; Roberto, C; Abergel, C; Renesto, P; Ogata, H; La Scola, B; Suzan, M; Clavérie, JM (2004). "La secuencia del genoma de 1,2 megabases de Mimivirus". Ciencia . 306 (5700): 1344–50. Código Bib : 2004 Ciencia... 306.1344R. doi : 10.1126/ciencia.1101485. PMID  15486256. S2CID  84298461.
  8. ^ abc Matthias G. Fischer; Michael J. Allen; William H. Wilson; Curtis A. Suttle (2010). "Virus gigante con un notable complemento de genes infecta zooplancton marino". Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 107 (45): 19508–13. Bibcode :2010PNAS..10719508F. doi : 10.1073/pnas.1007615107 . PMC 2984142 . PMID  20974979. 
  9. ^ DR Garza; CA Suttle (1995). "Grandes virus de ADN bicatenario que causan la lisis de un nanoflagelado heterotrófico marino (Bodo sp.) se encuentran en comunidades virales marinas naturales". Ecología microbiana acuática . 9 (3): 203–210. doi : 10.3354/ame009203 .
  10. ^ ab Colson P, Fournous G, Diene SM, Raoult D (2013). "Uso de codones, uso de aminoácidos, ARN de transferencia y amino-acil-ARNt sintetasas en Mimivirus". Intervirology . 56 (6): 364–75. doi : 10.1159/000354557 . PMID  24157883.
  11. ^ abc Gaia M, Benamar S, Boughalmi M, Pagnier I, Croce O, Colson P, Raoult D, La Scola B (2014). "Zamilon, un nuevo virófago con especificidad de huésped Mimiviridae". MÁS UNO . 9 (4): e94923. Código Bib : 2014PLoSO...994923G. doi : 10.1371/journal.pone.0094923 . PMC 3991649 . PMID  24747414. 
  12. ^ abc Véase también Abrahão & et al. 2018, fig. 4 en la pág. 5
  13. ^ Desnues C, La Scola B, Yutin N, Fournous G, Robert C, Azza S, Jardot P, Monteil S, Campocasso A, Koonin EV, Raoult D (octubre de 2012). "Provirófagos y transpovirones como mobiloma diverso de virus gigantes". Proc. Nacional. Acad. Ciencia. EE.UU . 109 (44): 18078–83. Código bibliográfico : 2012PNAS..10918078D. doi : 10.1073/pnas.1208835109 . PMC 3497776 . PMID  23071316. 
  14. ^ Yutin N, Wolf YI, Koonin EV (octubre de 2014). "Origen de virus gigantes a partir de virus de ADN más pequeños, no de un cuarto dominio de la vida celular". Virology . 466–467: 38–52. doi :10.1016/j.virol.2014.06.032. PMC 4325995 . PMID  25042053. 
  15. ^ Gaia M, Pagnier I, Campocasso A, Fournous G, Raoult D, La Scola B (2013). "El amplio espectro de virófagos de mimiviridae permite su aislamiento mediante un reportero de mimivirus". MÁS UNO . 8 (4): e61912. Código Bib : 2013PLoSO...861912G. doi : 10.1371/journal.pone.0061912 . PMC 3626643 . PMID  23596530. 
  16. ^ Para LBA111 y el megavirus del lago Powai, véase también Abrahão y otros, 2018, fig. 4 en la pág. 5
  17. ^ ab Zhang W, Zhou J, Liu T, Yu Y, Pan Y, Yan S, Wang Y (octubre de 2015). "Cuatro nuevos genomas de virus de algas descubiertos a partir de metagenomas del lago Yellowstone". Sci Rep . 5 : 15131. Bibcode :2015NatSR...515131Z. doi :10.1038/srep15131. PMC 4602308 . PMID  26459929. 
  18. ^ ab Deeg, CM; Chow, ECT; Suttle, CA (2018). "El virus Bodo saltans que infecta a los cinetoplastos (BsV), una ventana a los virus gigantes más abundantes en el mar". eLife . 7 : e33014. doi : 10.7554/eLife.33014 . PMC 5871332 . PMID  29582753. 
  19. ^ ab Jonathan Filée: Virus gigantes y sus elementos genéticos móviles: la hipótesis de la simbiosis molecular, en: Current Opinion in Virology, volumen 33, diciembre de 2018, págs. 81–88; bioRxiv  2018/04/11/299784
  20. ^ Genomas completos del NCBI: Virus, en busca del 'Lago Yellowstone'
  21. ^ Moniruzzaman, Mohammad; LeCleir, Gary R.; Brown, Christopher M.; Gobler, Christopher J.; Bidle, Kay D.; Wilson, William H.; Wilhelm, Steven W. (2014). "El genoma del virus de la marea parda (AaV), el pequeño gigante de Megaviridae, aclara la expansión del genoma del NCLDV y la coevolución entre huésped y virus". Virology . 466–467: 60–70. doi : 10.1016/j.virol.2014.06.031 . PMID  25035289.
  22. ^ Schvarcz CR, Steward GF (mayo de 2018). "Un virus gigante que infecta a las algas verdes codifica genes clave de la fermentación". Virology . 518 : 423–433. doi : 10.1016/j.virol.2018.03.010 . PMID  29649682.
    • "Hallaron un nuevo virus gigante en las aguas de Oahu, Hawái". ScienceDaily (nota de prensa). 3 de mayo de 2018.
  23. ^ Koonin EV, Krupovic M, Yutin N (abril de 2015). "Evolución de virus de ADN de doble cadena de eucariotas: de bacteriófagos a transposones y virus gigantes". Ann. NY Acad. Sci . 1341 (1): 10–24, véase la Figura 3. Bibcode :2015NYASA1341...10K. doi :10.1111/nyas.12728. PMC 4405056 . PMID  25727355. 
  24. ^ Yutin N, Colson P, Raoult D, Koonin EV (abril de 2013). "Mimiviridae: grupos de genes ortólogos, reconstrucción de la evolución del repertorio genético y propuesta de expansión de la familia de virus gigantes". Virol. J. 10 : 106. doi : 10.1186/1743-422X-10-106 . PMC 3620924. PMID  23557328 . 
  25. ^ Blog de Carolina Reyes y Kenneth Stedman: ¿Son los virus Phaeocystis globosa (OLPG) y el ficodnavirus Organic Lake parte de los Phycodnaviridae o Mimiviridae?, en ResearchGate, 8 de enero de 2016
  26. ^ Maruyama F, Ueki S (2016). "Evolución y filogenia de virus de ADN grandes, Mimiviridae y Phycodnaviridae, incluido el virus Heterosigma akashiwo recientemente caracterizado". Front Microbiol . 7 : 1942. doi : 10.3389/fmicb.2016.01942 . PMC 5127864 . PMID  27965659. 
  27. ^ Ghedin E, Claverie JM (agosto de 2005). "Parientes de Mimivirus en el mar de los Sargazos". Virol. J.2 : 62. arXiv : q-bio/0504014 . Código Bib : 2005q.bio..... 4014G. doi : 10.1186/1743-422X-2-62 . PMC 1215527 . PMID  16105173. 
  28. ^ Monier A, Claverie JM, Ogata H (2008). "Distribución taxonómica de virus de ADN de gran tamaño en el mar". Genome Biol . 9 (7): R106. doi : 10.1186/gb-2008-9-7-r106 . PMC 2530865 . PMID  18598358. 
  29. ^ abc Lad SB, Upadhyay M, Thorat P, Nair D, Moseley GW, Srivastava S, Pradeepkumar PI, Kondabagil K. Reconstitución bioquímica de la vía de reparación por escisión de la base de Mimivirus. J Mol Biol. 1 de septiembre de 2023;435(17):168188. doi: 10.1016/j.jmb.2023.168188. Publicación electrónica 26 de junio de 2023. PMID 37380013
  30. ^ Saadi H, Pagnier I, Colson P, Cherif JK, Beji M, Boughalmi M, Azza S, Armstrong N, Robert C, Fournous G, La Scola B, Raoult D (agosto de 2013). "Primer aislamiento de Mimivirus en un paciente con neumonía". Clin. Infect. Dis . 57 (4): e127–34. doi : 10.1093/cid/cit354 . PMID:  23709652.
  31. ^ Yoosuf N, Pagnier I, Fournous G, Robert C, La Scola B, Raoult D, Colson P (abril de 2014). "Secuencia completa del genoma del virus Courdo11, miembro de la familia Mimiviridae". Genes de virus . 48 (2): 218–23. doi :10.1007/s11262-013-1016-x. PMID  24293219. S2CID  12038772.
  32. ^ Sakhaee, Fatemeh; Vaziri, Farzam; Bahramali, Golnaz; Davar Siadat, Seyed; Fateh, Abolfazl (octubre de 2020). "Infección pulmonar relacionada con mimivirus en pacientes con discinesia ciliar primaria". Enfermedades infecciosas emergentes . 26 (10): 2524–2526. doi : 10.3201/eid2610.191613 . PMC 7510730 . PMID  32946733. 
  33. ^ La Scola, Bernard; Marrie, Thomas J.; Auffray, Jean-Pierre; Raoult, Didier (marzo de 2005). "Mimivirus en pacientes con neumonía". Enfermedades infecciosas emergentes . 11 (3): 449–452. doi : 10.3201/eid1103.040538 . PMC 3298252 . PMID  15757563. 
  34. ^ Saadi, Hanene; Pagnier, Isabelle; Colson, Philippe; Kanoun Cherif, Jouda; Beji, Majed; Boughalmi, Mondher; Azza, Saïd; Armstrong, Nicolás; Roberto, Catalina; Fournous, Ghislain; La Scola, Bernard (24 de mayo de 2013). "Primer aislamiento de Mimivirus en un paciente con neumonía". Enfermedades Infecciosas Clínicas . 57 (4): e127-e134. doi : 10.1093/cid/cit354 . PMID  23709652 - vía Oxford Academic.
  35. ^ Shah, N.; Hulsmeier, AJ; Hochhold, N.; Neidhart, M.; Gay, S.; Hennet, T. (2013). "La exposición al colágeno Mimivirus promueve la artritis". Revista de Virología . 88 (2): 838–45. doi :10.1128/JVI.03141-13. PMC 3911627 . PMID  24173233. 

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