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Atribacterota

Atribacterota es un filo de bacterias , que son comunes en sedimentos anóxicos ricos en metano . Se distribuyen en todo el mundo y en algunos casos son abundantes en sedimentos marinos anaeróbicos , manantiales geotermales y depósitos de petróleo . Los análisis genéticos sugieren un metabolismo heterotrófico que da lugar a productos de fermentación como acetato , etanol y CO2 . Estos productos a su vez pueden sustentar metanógenos dentro de la comunidad microbiana del sedimento y explicar la frecuente aparición de Atribacterota en sedimentos anóxicos ricos en metano. [2] [3] Según el análisis filogenético, Atribacterota parece estar relacionado con varios filos termófilos dentro de Terrabacteria [4] o puede estar en la base de Gracilicutes . [5] Según la investigación, Atribacterota muestra patrones de expresión genética que consisten en metabolismo fermentativo y acetogénico. Estas expresiones permiten a Atribacterota poder crear funciones catabólicas y anabólicas necesarias para generar la reproducción celular, incluso cuando los niveles de energía son limitados debido al agotamiento del oxígeno disuelto en las zonas de aguas marinas, aguas dulces o aguas subterráneas. [6]

Taxonomía

La taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) [7] y la Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) [8] se utilizaron como la autoridad taxonómica principal para establecer prioridades de nombres. También se consultó el sitio web Annotree [9] , que utiliza la versión 06-RS202 de GTDB. [10] .

Véase también

Referencias

  1. ^ Oren A, Garrity GM (2021). "Publicación válida de los nombres de cuarenta y dos filos de procariotas". Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . PMID  34694987. S2CID  239887308.
  2. ^ Nobu, MK, Dodsworth, JA, Murugapiran, SK, Rinke, C., Gies, EA, Webster, G., ... y Jørgensen, BB (2016) Filogenia y fisiología del filo candidato 'Atribacteria' (OP9/JS1) inferidas a partir de genómica independiente del cultivo. The ISME journal, 10(2), 273-286.
  3. ^ Carr, SA, Orcutt, BN, Mandernack, KW y Spear, JR (2015). Abundancia de atribacterias en sedimentos marinos profundos de la cuenca de Adelia, Antártida. Frontiers in microbiology, 6.
  4. ^ Christian Rinke et al 2013. Perspectivas sobre la filogenia y el potencial de codificación de la materia oscura microbiana. Nature Volumen: 499, Páginas: 431–437 doi:10.1038/nature12352
  5. ^ Hug, LA et al. 2016, Una nueva visión del árbol de la vida. Nature Microbiology, 1, 16048.
  6. ^ Vuillemin, Aurèle; Vargas, Sergio; Coskun, Ömer K.; Pockalny, Robert; Murray, Richard W.; Smith, David C.; D'Hondt, Steven; Orsi, William D. (11 de julio de 2020). "Atribacterias que se reproducen durante millones de años en el subsuelo abisal del Atlántico". mBio . 11 (5). bioRxiv 10.1101/2020.07.10.198200 . doi : 10.1128/mbio.01937-20 . PMC 7542362 . PMID  33024037.  
  7. ^ Sayers; et al. "Atribacterota". Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Consultado el 20 de marzo de 2021 .
  8. ^ JP Euzéby. "Atribacterota". Lista de nombres procariotas con posición en la nomenclatura (LPSN) . Consultado el 27 de junio de 2021 .
  9. ^ Mendler, K; Chen, H; Parks, DH; Hug, LA; Doxey, AC (2019). "AnnoTree: visualización y exploración de un árbol de la vida microbiano funcionalmente anotado". Investigación de ácidos nucleicos . 47 (9): 4442–4448. doi : 10.1093/nar/gkz246 . PMC 6511854 . PMID  31081040. Archivado desde el original el 23 de abril de 2021 . Consultado el 15 de julio de 2021 . 
  10. ^ "GTDB release 06-RS202". Base de datos de taxonomía del genoma .


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