Los alfacoronavirus (Alpha-CoV) son miembros del primero de los cuatro géneros ( Alpha- , Beta- , Gamma- y Delta- ) de coronavirus . Son virus de ARN monocatenario de sentido positivo que infectan a mamíferos , incluidos los humanos . Tienen viriones esféricos con proyecciones superficiales en forma de maza formadas por trímeros de la proteína de la espícula y una envoltura viral .
Los alfacoronavirus pertenecen a la subfamilia Orthocoronavirinae de la familia Coronaviridae . Tanto el linaje de los alfacoronavirus como el de los betacoronavirus descienden del acervo genético viral de los murciélagos . [1] [2] Los alfacoronavirus se conocían anteriormente como " coronavirus del filogrupo 1".
El género Alphacoronavirus es muy diverso, en particular en los murciélagos. La mayoría de las cepas originarias de murciélagos no se han aislado ni cultivado con éxito en el laboratorio. Los Alphacoronavirus que infectan a otras especies de mamíferos se han estudiado mucho mejor; consulte la Lista de aislamientos vivos de coronavirus .
El nombre alfacoronavirus se deriva del griego antiguo ἄλφα ( álpha , "la primera letra del alfabeto griego "), y κορώνη (korṓnē, "guirnalda, corona"), que significa corona, que describe la apariencia de las proyecciones superficiales vistas bajo microscopio electrónico que se asemejan a una corona solar . [3]
El virión tiene una envoltura esférica que mide entre 120 y 160 nm de diámetro y una cubierta central de unos 65 nm. Las glicoproteínas y los trímeros forman grandes proyecciones superficiales que crean la apariencia de una corona solar. Este género, al igual que otros coronavirus, tiene una proteína de espiga con una máquina de fusión de tipo I (S2) y un dominio de unión al receptor (S1). Se ensambla en un trímero. A diferencia de los beta- y gammacoronavirus, esta proteína no se divide en dos mitades. [4]
El genoma es ARN monocatenario de sentido positivo con una longitud de 27 a 29 kilobases y una cola de poliA 3'. Dos grandes ORF superpuestos en el extremo 5' del genoma codifican las principales proteínas no estructurales expresadas como una proteína de fusión por desplazamiento del marco ribosómico . Estas incluyen regiones con motivos de proteasa , helicasa y ARN polimerasa. Hay otros siete genes aguas abajo que codifican proteínas estructurales. Estas se expresan a partir de un conjunto anidado coterminal 3' de ARNm subgenómicos .
Se sabe que ambos tipos de Alphacoronavirus 1 , el coronavirus felino (FCoV) y el coronavirus canino (CCoV), existen en dos serotipos. El serotipo II se dirige a la aminopeptidasa N , mientras que el receptor del serotipo I es desconocido. La diferencia se debe a una proteína de pico diferente. [6] Hay un ancestro común para FCoV y CCoV. Este ancestro evolucionó gradualmente en FCoV I y CCoV I. Una proteína S de un virus desconocido se recombinó en el ancestro y dio lugar a CCoV II. CCoV II una vez más se recombinó con FCoV para crear FCoV II. CCoV II evolucionó gradualmente en TGEV. Una eliminación de la proteína de pico en TGEV crea PRCV. Todos estos virus se clasifican en el subgénero Tegacovirus . [6]
Se reconocen los siguientes subgéneros y especies: [7]