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Familia NiCoT

Las proteínas que actualmente se sabe que pertenecen a la familia de transportadores de Ni2 + -Co2 + (NiCoT) (TC# 2.A.52) se pueden encontrar en organismos que van desde bacterias Gram-negativas y Gram-positivas hasta arqueas y algunos eucariotas . Los miembros de esta familia catalizan la absorción de Ni2 + y/o Co2 + en un proceso dependiente de la fuerza motriz de protones . [1]

Estructura

Estas proteínas varían en tamaño desde aproximadamente 300 a 400 residuos de aminoacilo y poseen 6, 7 u 8 segmentos transmembrana (TMS), que se cree que son el resultado de una duplicación intragénica de 4 TMS, seguida de una eliminación de uno o dos TMS en los casos de las proteínas 7 o 6 TMS. Los análisis topológicos con el transportador HoxN Ni 2+ de Ralstonia eutropha ( Alcaligenes eutrophus ) sugieren que posee 8 TMS con sus extremos N y C en el citoplasma. El transportador Co 2+ (Ni 2+ ) de Rhodococcus rhodochrous , NhlF, exhibe ocho TMS putativos, y ocho TMS aparentes se revelan mediante análisis de hidropatía de múltiples alineaciones de secuencias de proteínas familiares. Un motivo HX 4 DH en la hélice 2 de la proteína HoxN se ha implicado en la unión de Ni 2+ , y tanto la hélice 1 como la hélice 2, que interactúan espacialmente, forman el filtro de selectividad. [2] En el homólogo NixA de Helicobacter pylori , se ha demostrado que varios motivos conservados son importantes para la unión y el transporte de Ni 2+ . [1] [3]

Se conoce al menos una estructura cristalina, determinada por Yu et al., [4] disponible en PDB : 4M58 ​.

Reacción

La reacción global catalizada por las proteínas de la familia NiCoT es: [1]

[Ni 2+ y/o Co 2+ ] (salida) → [Ni 2+ y/o Co 2+ ] (entrada).

Proteínas

Varias proteínas caracterizadas pertenecen a la familia de transportadores Ni 2+ -Co 2+ (NiCoT) (TC# 2.A.43). En la base de datos de clasificación de transportadores se puede encontrar una lista completa de estas proteínas junto con sus números de identificación de clasificación de transportadores (TCID), dominio, reino/filo y algunos ejemplos.

Referencias

  1. ^ abc Saier, Milton. "Base de datos de clasificación de transportadores: 2.A.52 La familia de transportadores Ni2+-Co2+ (NiCoT)". tcdb.org . Consultado el 4 de enero de 2016 .
  2. ^ Degen, O; Eitinger, T (julio de 2002). "Especificidad de sustrato de las permeasas de níquel/cobalto: perspectivas a partir de mutantes alterados en los dominios transmembrana I y II". J. Bacteriol . 184 (13): 3569–77. doi :10.1128/jb.184.13.3569-3577.2002. PMC 135128 . PMID  12057951. 
  3. ^ Wolfram, L; Bauerfeind, P (marzo de 2002). "Los aminoácidos de unión al níquel de baja afinidad conservados son esenciales para la función de la permeasa de níquel NixA de Helicobacter pylori". J. Bacteriol . 184 (5): 1438–43. doi :10.1128/JB.184.5.1438-1443.2002. PMC 134868 . PMID  11844775. 
  4. ^ Yu, Y; Zhou, M; Kirsch, F; Xu, C; Zhang, L; Wang, Y; Jiang, Z; Wang, N; Li, J; Eitinger, T; Yang, M (24 de diciembre de 2013). "El sitio de unión al sustrato planar dicta la especificidad de los transportadores de níquel/cobalto de tipo ECF". Cell Research . 24 (3): 267–277. doi :10.1038/cr.2013.172. PMC 3945884 . PMID  24366337. 

Lectura adicional